18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_3129 on replicon NC_009467
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009467  Acry_3129  hypothetical protein  100 
 
 
152 aa  317  3e-86  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1060  hypothetical protein  59.57 
 
 
154 aa  182  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.597208  normal  0.0759918 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5416  cupin 2 domain-containing protein  53.73 
 
 
149 aa  166  8e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.236661  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0863  hypothetical protein  50.76 
 
 
153 aa  148  2e-35  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.919764  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1305  hypothetical protein  48.25 
 
 
165 aa  141  3e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03688  hypothetical protein  47.86 
 
 
172 aa  132  9.999999999999999e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2381  hypothetical protein  48.15 
 
 
180 aa  128  3e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5028  hypothetical protein  39.58 
 
 
203 aa  104  4e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0640594  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0765  hypothetical protein  35.62 
 
 
189 aa  97.4  6e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.618728  normal  0.762349 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1344  hypothetical protein  36.84 
 
 
190 aa  97.1  7e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5207  hypothetical protein  33.57 
 
 
138 aa  71.2  0.000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46817  predicted protein  31.79 
 
 
194 aa  64.7  0.0000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.410977  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4231  cupin 2, barrel  34.43 
 
 
121 aa  59.7  0.00000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0098  hypothetical protein  31.9 
 
 
267 aa  44.7  0.0005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1980  hypothetical protein  26.77 
 
 
127 aa  42.7  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00382946 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1547  hypothetical protein  32.88 
 
 
133 aa  42.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.683626  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3051  cupin 2 domain-containing protein  37.7 
 
 
162 aa  42  0.003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1127  hypothetical protein  28.95 
 
 
120 aa  40.4  0.008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.332513 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>