15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_1151 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_1151    100 
 
 		 1435 bp  2845    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3060  hypothetical protein  90 
 
 		 897 bp  60  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.979021  normal  0.0493517 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8073  transposase IS4 family protein  82.2 
 
 		 1383 bp  60  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0927  transposase IS4 family protein  82.2 
 
 		 1383 bp  60  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3057  transposase IS4 family protein  82.2 
 
 		 1383 bp  60  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3346  transposase IS4 family protein  82.2 
 
 		 1383 bp  60  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4611  transposase IS4 family protein  82.2 
 
 		 1383 bp  60  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.239615  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4639  transposase IS4 family protein  82.2 
 
 		 1383 bp  60  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0787998  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6639  transposase IS4 family protein  82.2 
 
 		 1383 bp  60  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0557  transposase IS4 family protein  85.29 
 
 		 1377 bp  56  0.00003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.000649319  normal  0.755449 
 
 
-
 
NC_010514  Mrad2831_6370    87.5 
 
 		 1374 bp  56  0.00003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5124  IS4 family transposase  93.75 
 
 		 1374 bp  48.1  0.007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4905  IS4 family transposase  93.75 
 
 		 1374 bp  48.1  0.007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.24611 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2767  IS4 family transposase  93.75 
 
 		 1374 bp  48.1  0.007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3050  IS4 family transposase  93.75 
 
 		 1374 bp  48.1  0.007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000789979 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>