17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_5699 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007974  Rmet_5699  hypothetical protein  100 
 
 		 447 aa  900    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.674769  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1237  hypothetical protein  39.51 
 
 		 484 aa  288  2e-76  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.78414  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0418  hypothetical protein  35.74 
 
 		 551 aa  166  8e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.051405 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1523  hypothetical protein  27.4 
 
 		 423 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0086  periplasmic protein  29.53 
 
 		 435 aa  97.4  5e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0088  hypothetical protein  26.09 
 
 		 400 aa  88.6  2e-16  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.259915  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0128  hypothetical protein  25.8 
 
 		 400 aa  87  6e-16  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5090  hypothetical protein  50.67 
 
 		 123 aa  80.1  0.00000000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.106284  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0182  hypothetical protein  24.56 
 
 		 385 aa  74.3  0.000000000004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1763  putative curli production assembly/transport component CsgG  22.22 
 
 		 324 aa  63.2  0.00000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.281584  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3849  hypothetical protein  23.92 
 
 		 375 aa  58.5  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0636697  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2790  periplasmic protein  23.62 
 
 		 413 aa  57  0.0000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0097  putative periplasmic protein  30.53 
 
 		 311 aa  53.9  0.000005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4121  curli production assembly/transport component CsgG  21.4 
 
 		 323 aa  48.9  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4674  curli production assembly/transport component CsgG  24.77 
 
 		 337 aa  44.7  0.003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.501006  normal  0.0721593 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0391  curli production assembly/transport component CsgG  29.33 
 
 		 320 aa  45.1  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3644  curli production assembly/transport component CsgG  24.07 
 
 		 340 aa  43.9  0.006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.8014  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>