12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_1523 on replicon NC_009665
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009665  Shew185_1523  hypothetical protein  100 
 
 		 423 aa  856    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1237  hypothetical protein  28.03 
 
 		 484 aa  181  2e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.78414  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0086  periplasmic protein  28.83 
 
 		 435 aa  155  1e-36  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0418  hypothetical protein  28.77 
 
 		 551 aa  150  4e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.051405 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5699  hypothetical protein  27.4 
 
 		 447 aa  149  1.0000000000000001e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.674769  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0088  hypothetical protein  27.64 
 
 		 400 aa  113  7.000000000000001e-24  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.259915  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0128  hypothetical protein  27.64 
 
 		 400 aa  112  2.0000000000000002e-23  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0182  hypothetical protein  27.07 
 
 		 385 aa  102  1e-20  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2790  periplasmic protein  23.1 
 
 		 413 aa  78.2  0.0000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3849  hypothetical protein  22.73 
 
 		 375 aa  77  0.0000000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0636697  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0097  putative periplasmic protein  29.9 
 
 		 311 aa  51.6  0.00002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5090  hypothetical protein  40 
 
 		 123 aa  47.4  0.0005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.106284  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>