14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_0418 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_0418  hypothetical protein  100 
 
 		 551 aa  1108    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.051405 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1237  hypothetical protein  41.1 
 
 		 484 aa  224  4e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.78414  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5699  hypothetical protein  35.74 
 
 		 447 aa  167  2.9999999999999998e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.674769  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1523  hypothetical protein  27.08 
 
 		 423 aa  152  2e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0086  periplasmic protein  28.17 
 
 		 435 aa  78.2  0.0000000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5090  hypothetical protein  41.58 
 
 		 123 aa  72.4  0.00000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.106284  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0128  hypothetical protein  25.1 
 
 		 400 aa  72  0.00000000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0088  hypothetical protein  24.56 
 
 		 400 aa  70.5  0.00000000008  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.259915  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2790  periplasmic protein  23.83 
 
 		 413 aa  67.4  0.0000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3849  hypothetical protein  24.46 
 
 		 375 aa  60.8  0.00000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0636697  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0182  hypothetical protein  23.35 
 
 		 385 aa  59.3  0.0000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0097  putative periplasmic protein  28.3 
 
 		 311 aa  56.2  0.000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3644  curli production assembly/transport component CsgG  22.71 
 
 		 340 aa  49.7  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.8014  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1457  CsgG family protein, putative  21.84 
 
 		 330 aa  49.3  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>