39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_3374 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_3374  hypothetical protein  100 
 
 		 265 aa  539  9.999999999999999e-153  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3211  hypothetical protein  84.67 
 
 		 264 aa  468  1.0000000000000001e-131  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3031  hypothetical protein  75.68 
 
 		 264 aa  406  1.0000000000000001e-112  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3378  hypothetical protein  75.29 
 
 		 264 aa  405  1.0000000000000001e-112  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3094  hypothetical protein  73.36 
 
 		 264 aa  382  1e-105  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3667  hypothetical protein  41.38 
 
 		 270 aa  211  1e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0604472  hitchhiker  0.0000000708936 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0325  hypothetical protein  42.05 
 
 		 273 aa  205  6e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2781  hypothetical protein  42.05 
 
 		 273 aa  205  6e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.28645  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0244  hypothetical protein  43.02 
 
 		 271 aa  204  9e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0290  hypothetical protein  42.53 
 
 		 270 aa  203  3e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0253  hypothetical protein  42.26 
 
 		 271 aa  202  6e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00334487 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0305  hypothetical protein  41.29 
 
 		 273 aa  201  7e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.226888  hitchhiker  0.00040374 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3424  hypothetical protein  41.76 
 
 		 270 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.993527  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2862  hypothetical protein  41.15 
 
 		 271 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0026844 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3841  hypothetical protein  39.77 
 
 		 276 aa  195  5.000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.634738  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0012  hypothetical protein  39.77 
 
 		 276 aa  195  5.000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3780  hypothetical protein  39.77 
 
 		 276 aa  195  5.000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.384905  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2578  hypothetical protein  39.77 
 
 		 276 aa  195  7e-49  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0007  hypothetical protein  39.77 
 
 		 276 aa  195  7e-49  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0790789  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1979  hypothetical protein  39.77 
 
 		 276 aa  195  7e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.887624  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0227  hypothetical protein  39.77 
 
 		 274 aa  193  3e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.390276  hitchhiker  0.000519653 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3116  hypothetical protein  39.44 
 
 		 271 aa  187  1e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00745763  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3532  hypothetical protein  39.44 
 
 		 271 aa  187  1e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3102  hypothetical protein  39.15 
 
 		 276 aa  187  2e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.455016  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3106  hypothetical protein  27.15 
 
 		 289 aa  80.9  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.960294  normal  0.118679 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2808  hypothetical protein  24.54 
 
 		 267 aa  67  0.0000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000066869 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2800  hypothetical protein  23.93 
 
 		 267 aa  64.7  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2610  hypothetical protein  23.93 
 
 		 267 aa  64.7  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.318158  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1887  hypothetical protein  21.82 
 
 		 334 aa  50.4  0.00003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.505628  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2652  hypothetical protein  20 
 
 		 320 aa  50.1  0.00004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00068321  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2694  hypothetical protein  19.39 
 
 		 334 aa  47.4  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.490184  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2371  hypothetical protein  18.56 
 
 		 334 aa  45.8  0.0007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2643  hypothetical protein  19.12 
 
 		 334 aa  45.8  0.0007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000128087 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2625  hypothetical protein  19.12 
 
 		 334 aa  45.8  0.0008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.576375  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5277  hypothetical protein  25 
 
 		 282 aa  45.1  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.672646  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2407  hypothetical protein  20.08 
 
 		 333 aa  45.1  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00396683  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2675  hypothetical protein  20.08 
 
 		 334 aa  45.1  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.18148 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2446  hypothetical protein  19.12 
 
 		 350 aa  45.4  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.283712  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2515  hypothetical protein  18.9 
 
 		 334 aa  42  0.01  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>