25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_3106 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_3106  hypothetical protein  100 
 
 
289 aa  590  1e-168  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.960294  normal  0.118679 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2610  hypothetical protein  27.85 
 
 
267 aa  93.2  4e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.318158  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2800  hypothetical protein  27.85 
 
 
267 aa  93.2  4e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2808  hypothetical protein  27.85 
 
 
267 aa  92.8  6e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000066869 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3374  hypothetical protein  27.15 
 
 
265 aa  81.6  0.00000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3211  hypothetical protein  24.04 
 
 
264 aa  71.2  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2058  hypothetical protein  23.72 
 
 
247 aa  69.3  0.00000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.379466  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2652  hypothetical protein  23.55 
 
 
320 aa  67  0.0000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00068321  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1887  hypothetical protein  23.02 
 
 
334 aa  64.7  0.000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.505628  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2694  hypothetical protein  23.63 
 
 
334 aa  64.7  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.490184  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2649  hypothetical protein  23.29 
 
 
334 aa  62.4  0.000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2643  hypothetical protein  22.7 
 
 
334 aa  60.8  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000128087 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2625  hypothetical protein  22.53 
 
 
334 aa  59.3  0.00000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.576375  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2446  hypothetical protein  22.65 
 
 
350 aa  58.9  0.00000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.283712  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3378  hypothetical protein  22.73 
 
 
264 aa  58.5  0.0000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2675  hypothetical protein  22.95 
 
 
334 aa  58.5  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.18148 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3031  hypothetical protein  22.49 
 
 
264 aa  56.2  0.0000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2371  hypothetical protein  21.71 
 
 
334 aa  55.8  0.0000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2862  hypothetical protein  25.26 
 
 
271 aa  54.3  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0026844 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2515  hypothetical protein  21.26 
 
 
334 aa  53.9  0.000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2407  hypothetical protein  22.45 
 
 
333 aa  53.5  0.000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00396683  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0528  hypothetical protein  23.93 
 
 
320 aa  53.5  0.000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00290124  normal  0.108482 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3094  hypothetical protein  24.05 
 
 
264 aa  52.4  0.000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5277  hypothetical protein  22.76 
 
 
282 aa  50.1  0.00004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.672646  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3667  hypothetical protein  20.61 
 
 
270 aa  43.9  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0604472  hitchhiker  0.0000000708936 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>