37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc3094 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc3094  hypothetical protein  100 
 
 		 264 aa  532  1e-150  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3031  hypothetical protein  92.05 
 
 		 264 aa  497  1e-140  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3378  hypothetical protein  90.91 
 
 		 264 aa  490  9.999999999999999e-139  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3374  hypothetical protein  73.36 
 
 		 265 aa  398  9.999999999999999e-111  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3211  hypothetical protein  72.31 
 
 		 264 aa  395  1e-109  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3667  hypothetical protein  44.83 
 
 		 270 aa  224  2e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0604472  hitchhiker  0.0000000708936 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0290  hypothetical protein  45.59 
 
 		 270 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0244  hypothetical protein  46.48 
 
 		 271 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0253  hypothetical protein  46.09 
 
 		 271 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00334487 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2862  hypothetical protein  43.13 
 
 		 271 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0026844 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2781  hypothetical protein  44.32 
 
 		 273 aa  207  2e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.28645  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0325  hypothetical protein  44.32 
 
 		 273 aa  207  2e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3424  hypothetical protein  43.3 
 
 		 270 aa  206  3e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.993527  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2578  hypothetical protein  41.97 
 
 		 276 aa  206  3e-52  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0007  hypothetical protein  41.97 
 
 		 276 aa  206  3e-52  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0790789  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1979  hypothetical protein  41.97 
 
 		 276 aa  206  3e-52  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.887624  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0305  hypothetical protein  44.32 
 
 		 273 aa  206  4e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.226888  hitchhiker  0.00040374 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0012  hypothetical protein  41.61 
 
 		 276 aa  205  6e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3780  hypothetical protein  41.61 
 
 		 276 aa  205  6e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.384905  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3841  hypothetical protein  41.61 
 
 		 276 aa  205  6e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.634738  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0227  hypothetical protein  44.14 
 
 		 274 aa  202  5e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.390276  hitchhiker  0.000519653 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3102  hypothetical protein  41.24 
 
 		 276 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.455016  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3532  hypothetical protein  41.73 
 
 		 271 aa  198  6e-50  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3116  hypothetical protein  41.73 
 
 		 271 aa  198  6e-50  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00745763  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2610  hypothetical protein  22.43 
 
 		 267 aa  72.4  0.000000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.318158  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2800  hypothetical protein  22.43 
 
 		 267 aa  72.4  0.000000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2808  hypothetical protein  22.43 
 
 		 267 aa  72  0.000000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000066869 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3106  hypothetical protein  23.96 
 
 		 289 aa  57  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.960294  normal  0.118679 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5277  hypothetical protein  25.47 
 
 		 282 aa  47  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.672646  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2625  hypothetical protein  21.09 
 
 		 334 aa  47  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.576375  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2694  hypothetical protein  20.68 
 
 		 334 aa  47  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.490184  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2446  hypothetical protein  21.09 
 
 		 350 aa  47  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.283712  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2652  hypothetical protein  19.62 
 
 		 320 aa  47  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00068321  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2675  hypothetical protein  19.77 
 
 		 334 aa  45.8  0.0006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.18148 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2643  hypothetical protein  20.73 
 
 		 334 aa  45.8  0.0007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000128087 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2515  hypothetical protein  20.82 
 
 		 334 aa  44.7  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2371  hypothetical protein  20.63 
 
 		 334 aa  43.9  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>