29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A0290 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007951  Bxe_A0290  hypothetical protein  100 
 
 
270 aa  536  1e-151  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3667  hypothetical protein  91.48 
 
 
270 aa  500  1e-141  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0604472  hitchhiker  0.0000000708936 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2862  hypothetical protein  63.81 
 
 
271 aa  325  4.0000000000000003e-88  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0026844 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2578  hypothetical protein  58.82 
 
 
276 aa  279  4e-74  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0012  hypothetical protein  58.82 
 
 
276 aa  279  4e-74  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3841  hypothetical protein  58.82 
 
 
276 aa  279  4e-74  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.634738  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3780  hypothetical protein  58.82 
 
 
276 aa  279  4e-74  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.384905  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1979  hypothetical protein  58.82 
 
 
276 aa  279  4e-74  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.887624  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0007  hypothetical protein  58.82 
 
 
276 aa  279  4e-74  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0790789  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3102  hypothetical protein  58.04 
 
 
276 aa  276  4e-73  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.455016  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3532  hypothetical protein  58 
 
 
271 aa  268  5e-71  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3116  hypothetical protein  58 
 
 
271 aa  268  5e-71  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00745763  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0244  hypothetical protein  56.03 
 
 
271 aa  262  4e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0253  hypothetical protein  55.25 
 
 
271 aa  260  2e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00334487 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0325  hypothetical protein  55.29 
 
 
273 aa  254  8e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2781  hypothetical protein  55.29 
 
 
273 aa  254  8e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.28645  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0305  hypothetical protein  54.9 
 
 
273 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.226888  hitchhiker  0.00040374 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3424  hypothetical protein  52.01 
 
 
270 aa  246  3e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.993527  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0227  hypothetical protein  52.53 
 
 
274 aa  241  1e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.390276  hitchhiker  0.000519653 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3031  hypothetical protein  45.59 
 
 
264 aa  226  2e-58  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3378  hypothetical protein  44.83 
 
 
264 aa  223  3e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3211  hypothetical protein  43.68 
 
 
264 aa  223  4e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3094  hypothetical protein  45.59 
 
 
264 aa  218  8.999999999999998e-56  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3374  hypothetical protein  42.53 
 
 
265 aa  216  4e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2610  hypothetical protein  21.35 
 
 
267 aa  55.8  0.0000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.318158  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2800  hypothetical protein  21.35 
 
 
267 aa  55.8  0.0000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2808  hypothetical protein  21.35 
 
 
267 aa  55.5  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000066869 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3106  hypothetical protein  20.41 
 
 
289 aa  46.2  0.0005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.960294  normal  0.118679 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1887  hypothetical protein  22.68 
 
 
334 aa  43.1  0.005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.505628  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>