32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_0244 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008390  Bamb_0244  hypothetical protein  100 
 
 		 271 aa  540  1e-153  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0253  hypothetical protein  98.15 
 
 		 271 aa  531  1e-150  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00334487 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0325  hypothetical protein  91.67 
 
 		 273 aa  478  1e-134  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2781  hypothetical protein  91.67 
 
 		 273 aa  478  1e-134  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.28645  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0305  hypothetical protein  90.53 
 
 		 273 aa  474  1e-133  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.226888  hitchhiker  0.00040374 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3424  hypothetical protein  89.47 
 
 		 270 aa  468  1.0000000000000001e-131  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.993527  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0227  hypothetical protein  85.61 
 
 		 274 aa  456  1e-127  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.390276  hitchhiker  0.000519653 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3102  hypothetical protein  69.8 
 
 		 276 aa  355  5.999999999999999e-97  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.455016  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0012  hypothetical protein  69.02 
 
 		 276 aa  351  7e-96  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3780  hypothetical protein  69.02 
 
 		 276 aa  351  7e-96  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.384905  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3841  hypothetical protein  69.02 
 
 		 276 aa  351  7e-96  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.634738  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2578  hypothetical protein  69.02 
 
 		 276 aa  351  8e-96  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0007  hypothetical protein  69.02 
 
 		 276 aa  351  8e-96  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0790789  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1979  hypothetical protein  69.02 
 
 		 276 aa  351  8e-96  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.887624  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3116  hypothetical protein  68 
 
 		 271 aa  338  4e-92  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00745763  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3532  hypothetical protein  68 
 
 		 271 aa  338  4e-92  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3667  hypothetical protein  54.86 
 
 		 270 aa  265  8.999999999999999e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0604472  hitchhiker  0.0000000708936 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2862  hypothetical protein  52.79 
 
 		 271 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0026844 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0290  hypothetical protein  54.86 
 
 		 270 aa  250  2e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3031  hypothetical protein  46.62 
 
 		 264 aa  214  9.999999999999999e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3378  hypothetical protein  45.86 
 
 		 264 aa  208  9e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3211  hypothetical protein  43.92 
 
 		 264 aa  206  3e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3374  hypothetical protein  43.02 
 
 		 265 aa  204  9e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3094  hypothetical protein  46.48 
 
 		 264 aa  197  1.0000000000000001e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2800  hypothetical protein  21 
 
 		 267 aa  49.7  0.00004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2610  hypothetical protein  21 
 
 		 267 aa  49.7  0.00004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.318158  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2808  hypothetical protein  21 
 
 		 267 aa  49.3  0.00006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000066869 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0596  hypothetical protein  24.47 
 
 		 285 aa  49.3  0.00007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.802642 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0571  hypothetical protein  24.47 
 
 		 285 aa  49.3  0.00007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0602  hypothetical protein  24.47 
 
 		 285 aa  49.3  0.00007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3865  hypothetical protein  24.47 
 
 		 285 aa  49.3  0.00007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00003559 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5277  hypothetical protein  25.18 
 
 		 282 aa  43.5  0.004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.672646  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>