61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_1193 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_1193  hypothetical protein  100 
 
 		 231 aa  445  1.0000000000000001e-124  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00338949  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1300  hypothetical protein  57.55 
 
 		 226 aa  233  2.0000000000000002e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.559066  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4222  hypothetical protein  36.74 
 
 		 207 aa  104  1e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.210811 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1976  hypothetical protein  32.5 
 
 		 224 aa  92.4  5e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0596109  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1378  hypothetical protein  31.19 
 
 		 227 aa  89.7  4e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.157489  hitchhiker  0.00418974 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1213  integral membrane protein  32.21 
 
 		 221 aa  88.2  9e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3177  hypothetical protein  30.88 
 
 		 224 aa  87  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.963449  normal  0.277595 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1271  putative integral membrane protein  30.47 
 
 		 221 aa  84  0.000000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0519  putative integral membrane protein  30.73 
 
 		 235 aa  83.6  0.000000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00000288688  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1618  hypothetical protein  29.81 
 
 		 221 aa  80.9  0.00000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1271  membrane protein-like protein  28.77 
 
 		 213 aa  78.2  0.0000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1057  membrane protein-like protein  32 
 
 		 224 aa  76.6  0.0000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000521031  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2266  hypothetical protein  31.34 
 
 		 221 aa  74.3  0.000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0395886  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2258  membrane protein-like protein  30.5 
 
 		 224 aa  73.6  0.000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.111038  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2137  membrane protein-like protein  30.5 
 
 		 224 aa  72.4  0.000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00282185  normal  0.946217 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1608  membrane protein-like  29.5 
 
 		 224 aa  72.4  0.000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0433487  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2244  membrane protein-like protein  29.5 
 
 		 224 aa  72.4  0.000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00331995  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2220  membrane protein-like protein  29.5 
 
 		 224 aa  72.4  0.000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.490411  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5548  membrane protein-like  30 
 
 		 224 aa  72.4  0.000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00289622  normal  0.29148 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4826  hypothetical protein  28.78 
 
 		 229 aa  72  0.000000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.548559  normal  0.399285 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2847  hypothetical protein  36.65 
 
 		 221 aa  67.4  0.0000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.321137  normal  0.576348 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1093  hypothetical protein  29.5 
 
 		 224 aa  66.6  0.0000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0281533  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1470  hypothetical protein  28.57 
 
 		 224 aa  65.9  0.0000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000039348  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1796  hypothetical protein  28.57 
 
 		 224 aa  65.9  0.0000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0318307  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0447  hypothetical protein  28.57 
 
 		 224 aa  65.9  0.0000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0426416  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1164  hypothetical protein  28.57 
 
 		 224 aa  65.9  0.0000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000207378  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0705  hypothetical protein  28.57 
 
 		 224 aa  65.9  0.0000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000216934  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1333  hypothetical protein  28.57 
 
 		 224 aa  65.9  0.0000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1324  hypothetical protein  28.57 
 
 		 224 aa  65.9  0.0000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0672472  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1461  hypothetical protein  28.64 
 
 		 220 aa  65.1  0.0000000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003979  membrane protein  21.32 
 
 		 221 aa  64.3  0.000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2009  integral membrane protein  31.16 
 
 		 227 aa  65.1  0.000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.265037  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1709  hypothetical protein  28.41 
 
 		 229 aa  63.5  0.000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.349747  normal  0.551967 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01543  hypothetical protein  22.34 
 
 		 221 aa  63.5  0.000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3158  hypothetical protein  31.51 
 
 		 224 aa  63.5  0.000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0629  hypothetical protein  29.86 
 
 		 262 aa  63.2  0.000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2505  hypothetical protein  31.51 
 
 		 224 aa  63.5  0.000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.147248  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2670  hypothetical protein  28.41 
 
 		 229 aa  63.2  0.000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0247863  normal  0.0326999 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1672  hypothetical protein  28.41 
 
 		 229 aa  63.5  0.000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1687  hypothetical protein  28.41 
 
 		 229 aa  63.5  0.000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2882  putative integral membrane protein  28.08 
 
 		 221 aa  62.8  0.000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0670  hypothetical protein  29.86 
 
 		 262 aa  62.4  0.000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0387527 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5168  hypothetical protein  28.92 
 
 		 229 aa  60.1  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.172101  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0675  hypothetical protein  29.38 
 
 		 227 aa  58.5  0.00000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58810  hypothetical protein  28.71 
 
 		 229 aa  58.5  0.00000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.205453 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12040  hypothetical protein  26.98 
 
 		 228 aa  57.8  0.0000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0339582  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1579  hypothetical protein  36.14 
 
 		 224 aa  58.2  0.0000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0394549  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2418  hypothetical protein  28.78 
 
 		 229 aa  58.2  0.0000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2108  hypothetical protein  35.96 
 
 		 229 aa  56.6  0.0000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2488  hypothetical protein  28.29 
 
 		 229 aa  56.6  0.0000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.254099  normal  0.183703 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2580  hypothetical protein  28.29 
 
 		 229 aa  56.2  0.0000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.137209 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1561  hypothetical protein  25.25 
 
 		 229 aa  55.5  0.0000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3022  hypothetical protein  25.13 
 
 		 226 aa  53.1  0.000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2798  hypothetical protein  25.36 
 
 		 230 aa  52.8  0.000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0838  hypothetical protein  24.74 
 
 		 227 aa  53.1  0.000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02431  hypothetical protein  26.29 
 
 		 203 aa  51.6  0.00001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0263  putative integral membrane protein  25.35 
 
 		 221 aa  50.1  0.00003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.138608  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4541  hypothetical protein  27.27 
 
 		 246 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0769  membrane protein-like protein  29.2 
 
 		 229 aa  47  0.0003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2649  hypothetical protein  21.08 
 
 		 218 aa  42.7  0.005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0297  hypothetical protein  23.04 
 
 		 219 aa  41.6  0.01  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>