59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal223_2670 on replicon NC_011663
Organism: Shewanella baltica OS223



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011663  Sbal223_2670  hypothetical protein  100 
 
 
229 aa  459  9.999999999999999e-129  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0247863  normal  0.0326999 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1672  hypothetical protein  99.56 
 
 
229 aa  458  9.999999999999999e-129  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1687  hypothetical protein  98.69 
 
 
229 aa  455  1e-127  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1709  hypothetical protein  98.69 
 
 
229 aa  453  1e-127  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.349747  normal  0.551967 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2580  hypothetical protein  82.53 
 
 
229 aa  370  1e-102  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.137209 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2488  hypothetical protein  82.1 
 
 
229 aa  371  1e-102  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.254099  normal  0.183703 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2418  hypothetical protein  82.53 
 
 
229 aa  373  1e-102  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1561  hypothetical protein  80.35 
 
 
229 aa  370  1e-102  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2798  hypothetical protein  77.73 
 
 
230 aa  351  4e-96  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3022  hypothetical protein  58.22 
 
 
226 aa  271  7e-72  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0838  hypothetical protein  54.42 
 
 
227 aa  243  3e-63  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2108  hypothetical protein  52.84 
 
 
229 aa  225  4e-58  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1461  hypothetical protein  40.91 
 
 
220 aa  153  2e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003979  membrane protein  34.8 
 
 
221 aa  140  1.9999999999999998e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01543  hypothetical protein  36.32 
 
 
221 aa  137  2e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02431  hypothetical protein  35.23 
 
 
203 aa  124  9e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2649  hypothetical protein  31.73 
 
 
218 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2882  putative integral membrane protein  34.59 
 
 
221 aa  101  9e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1271  putative integral membrane protein  32.34 
 
 
221 aa  97.8  1e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1213  integral membrane protein  35.45 
 
 
221 aa  95.5  6e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2366  membrane protein-like protein  35.37 
 
 
221 aa  90.1  2e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.538782  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0519  putative integral membrane protein  31.52 
 
 
235 aa  89.7  3e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00000288688  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12040  hypothetical protein  31.03 
 
 
228 aa  86.7  3e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0339582  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2266  hypothetical protein  32.14 
 
 
221 aa  83.2  0.000000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0395886  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0297  hypothetical protein  32.47 
 
 
219 aa  82.4  0.000000000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0670  hypothetical protein  27.72 
 
 
262 aa  75.9  0.0000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0387527 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0629  hypothetical protein  27.72 
 
 
262 aa  75.5  0.0000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4826  hypothetical protein  28.11 
 
 
229 aa  73.2  0.000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.548559  normal  0.399285 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4541  hypothetical protein  29.89 
 
 
246 aa  73.6  0.000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0263  putative integral membrane protein  29.45 
 
 
221 aa  71.6  0.000000000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.138608  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1976  hypothetical protein  28.96 
 
 
224 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0596109  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0675  hypothetical protein  28.34 
 
 
227 aa  70.5  0.00000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58810  hypothetical protein  27.57 
 
 
229 aa  69.7  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.205453 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1618  hypothetical protein  29.95 
 
 
221 aa  70.1  0.00000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5168  hypothetical protein  27.57 
 
 
229 aa  68.9  0.00000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.172101  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2009  integral membrane protein  34.62 
 
 
227 aa  67.8  0.0000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.265037  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1378  hypothetical protein  28.02 
 
 
227 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.157489  hitchhiker  0.00418974 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1193  hypothetical protein  28.87 
 
 
231 aa  66.6  0.0000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00338949  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3177  hypothetical protein  27.47 
 
 
224 aa  66.2  0.0000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.963449  normal  0.277595 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1300  hypothetical protein  33.16 
 
 
226 aa  62.4  0.000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.559066  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0769  membrane protein-like protein  30.37 
 
 
229 aa  62  0.000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2220  membrane protein-like protein  28.18 
 
 
224 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.490411  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1608  membrane protein-like  28.18 
 
 
224 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0433487  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2244  membrane protein-like protein  28.18 
 
 
224 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00331995  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5548  membrane protein-like  27.07 
 
 
224 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00289622  normal  0.29148 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1057  membrane protein-like protein  27.07 
 
 
224 aa  58.5  0.00000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000521031  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2258  membrane protein-like protein  27.07 
 
 
224 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.111038  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2137  membrane protein-like protein  27.07 
 
 
224 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00282185  normal  0.946217 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4222  hypothetical protein  32.03 
 
 
207 aa  55.8  0.0000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.210811 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1271  membrane protein-like protein  25.79 
 
 
213 aa  52.8  0.000004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1324  hypothetical protein  25.49 
 
 
224 aa  49.3  0.00004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0672472  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1333  hypothetical protein  25.49 
 
 
224 aa  49.3  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0447  hypothetical protein  25.49 
 
 
224 aa  49.3  0.00004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0426416  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1470  hypothetical protein  25.49 
 
 
224 aa  49.3  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000039348  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0705  hypothetical protein  25.49 
 
 
224 aa  49.3  0.00004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000216934  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1164  hypothetical protein  25.49 
 
 
224 aa  49.3  0.00004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000207378  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1796  hypothetical protein  25.49 
 
 
224 aa  49.3  0.00004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0318307  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2847  hypothetical protein  28.99 
 
 
221 aa  49.3  0.00005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.321137  normal  0.576348 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1093  hypothetical protein  25.41 
 
 
224 aa  47.8  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0281533  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>