57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1710b_1470 on replicon NC_007434
Organism: Burkholderia pseudomallei 1710b



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008836  BMA10229_A0705  hypothetical protein  100 
 
 
224 aa  422  1e-117  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000216934  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1796  hypothetical protein  100 
 
 
224 aa  422  1e-117  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0318307  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1164  hypothetical protein  100 
 
 
224 aa  422  1e-117  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000207378  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1324  hypothetical protein  99.55 
 
 
224 aa  421  1e-117  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0672472  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1470  hypothetical protein  100 
 
 
224 aa  422  1e-117  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000039348  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1333  hypothetical protein  100 
 
 
224 aa  422  1e-117  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0447  hypothetical protein  100 
 
 
224 aa  422  1e-117  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0426416  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1093  hypothetical protein  97.77 
 
 
224 aa  350  1e-95  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0281533  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1378  hypothetical protein  73.54 
 
 
227 aa  333  1e-90  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.157489  hitchhiker  0.00418974 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3177  hypothetical protein  73.09 
 
 
224 aa  328  3e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.963449  normal  0.277595 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5548  membrane protein-like  80.8 
 
 
224 aa  314  6e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00289622  normal  0.29148 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1608  membrane protein-like  80.36 
 
 
224 aa  314  6e-85  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0433487  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2244  membrane protein-like protein  80.36 
 
 
224 aa  314  6e-85  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00331995  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2220  membrane protein-like protein  80.36 
 
 
224 aa  314  6e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.490411  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2258  membrane protein-like protein  80.36 
 
 
224 aa  313  9.999999999999999e-85  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.111038  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2137  membrane protein-like protein  80.36 
 
 
224 aa  312  1.9999999999999998e-84  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00282185  normal  0.946217 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1057  membrane protein-like protein  79.02 
 
 
224 aa  313  1.9999999999999998e-84  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000521031  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1976  hypothetical protein  70.85 
 
 
224 aa  308  4e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0596109  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0519  putative integral membrane protein  31.75 
 
 
235 aa  86.7  3e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00000288688  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1300  hypothetical protein  35.64 
 
 
226 aa  81.3  0.00000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.559066  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1213  integral membrane protein  33.18 
 
 
221 aa  79.7  0.00000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1193  hypothetical protein  28.57 
 
 
231 aa  75.5  0.0000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00338949  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1271  putative integral membrane protein  27.23 
 
 
221 aa  74.3  0.000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003979  membrane protein  23.2 
 
 
221 aa  69.7  0.00000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01543  hypothetical protein  25.27 
 
 
221 aa  67.8  0.0000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02431  hypothetical protein  25.27 
 
 
203 aa  61.2  0.00000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3022  hypothetical protein  28.88 
 
 
226 aa  60.5  0.00000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0629  hypothetical protein  27.94 
 
 
262 aa  59.7  0.00000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1271  membrane protein-like protein  28.39 
 
 
213 aa  58.9  0.00000006  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1618  hypothetical protein  24.75 
 
 
221 aa  58.2  0.0000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0670  hypothetical protein  27.45 
 
 
262 aa  58.2  0.0000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0387527 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12040  hypothetical protein  25.98 
 
 
228 aa  56.6  0.0000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0339582  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2009  integral membrane protein  31.78 
 
 
227 aa  56.6  0.0000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.265037  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5168  hypothetical protein  27.67 
 
 
229 aa  56.6  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.172101  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2266  hypothetical protein  28.87 
 
 
221 aa  56.2  0.0000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0395886  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2366  membrane protein-like protein  28.74 
 
 
221 aa  56.2  0.0000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.538782  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4541  hypothetical protein  26.09 
 
 
246 aa  55.5  0.0000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58810  hypothetical protein  27.18 
 
 
229 aa  55.1  0.0000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.205453 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0675  hypothetical protein  28.5 
 
 
227 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2882  putative integral membrane protein  28.19 
 
 
221 aa  53.1  0.000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2670  hypothetical protein  25.49 
 
 
229 aa  52.4  0.000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0247863  normal  0.0326999 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2108  hypothetical protein  28.74 
 
 
229 aa  52  0.000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1672  hypothetical protein  25.49 
 
 
229 aa  52  0.000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1709  hypothetical protein  25.49 
 
 
229 aa  52  0.000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.349747  normal  0.551967 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1687  hypothetical protein  25.3 
 
 
229 aa  51.2  0.00001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0838  hypothetical protein  25.13 
 
 
227 aa  51.2  0.00001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1461  hypothetical protein  23.38 
 
 
220 aa  50.1  0.00003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4826  hypothetical protein  26.07 
 
 
229 aa  50.1  0.00003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.548559  normal  0.399285 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1561  hypothetical protein  25.54 
 
 
229 aa  49.3  0.00005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2798  hypothetical protein  26.97 
 
 
230 aa  49.3  0.00005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2580  hypothetical protein  26.63 
 
 
229 aa  48.1  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.137209 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2418  hypothetical protein  27.27 
 
 
229 aa  47.8  0.0001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2488  hypothetical protein  26.74 
 
 
229 aa  46.2  0.0004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.254099  normal  0.183703 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2847  hypothetical protein  33.79 
 
 
221 aa  46.2  0.0004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.321137  normal  0.576348 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0263  putative integral membrane protein  26.11 
 
 
221 aa  44.7  0.001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.138608  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4222  hypothetical protein  27.94 
 
 
207 aa  44.3  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.210811 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0769  membrane protein-like protein  28.19 
 
 
229 aa  41.6  0.009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>