59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_1271 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008340  Mlg_1271  putative integral membrane protein  100 
 
 
221 aa  433  1e-120  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2882  putative integral membrane protein  44.44 
 
 
221 aa  150  1e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02431  hypothetical protein  35.96 
 
 
203 aa  143  2e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2649  hypothetical protein  37.23 
 
 
218 aa  137  2e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0519  putative integral membrane protein  37.1 
 
 
235 aa  136  2e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00000288688  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0263  putative integral membrane protein  33.48 
 
 
221 aa  128  8.000000000000001e-29  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.138608  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003979  membrane protein  34.04 
 
 
221 aa  127  1.0000000000000001e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1618  hypothetical protein  34.98 
 
 
221 aa  124  1e-27  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4826  hypothetical protein  33.99 
 
 
229 aa  124  1e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.548559  normal  0.399285 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1213  integral membrane protein  34.32 
 
 
221 aa  124  1e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01543  hypothetical protein  31.91 
 
 
221 aa  124  2e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12040  hypothetical protein  37.93 
 
 
228 aa  122  4e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0339582  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0297  hypothetical protein  36.7 
 
 
219 aa  122  4e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0670  hypothetical protein  35.15 
 
 
262 aa  121  8e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0387527 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2266  hypothetical protein  35.87 
 
 
221 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0395886  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0629  hypothetical protein  34.65 
 
 
262 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58810  hypothetical protein  33.5 
 
 
229 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.205453 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5168  hypothetical protein  33.5 
 
 
229 aa  116  3e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.172101  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3022  hypothetical protein  32.66 
 
 
226 aa  112  6e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4541  hypothetical protein  35.64 
 
 
246 aa  109  3e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0675  hypothetical protein  35.64 
 
 
227 aa  109  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1461  hypothetical protein  33.68 
 
 
220 aa  105  6e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2366  membrane protein-like protein  32.29 
 
 
221 aa  105  8e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.538782  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1561  hypothetical protein  31.53 
 
 
229 aa  104  1e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0769  membrane protein-like protein  35.86 
 
 
229 aa  102  4e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2798  hypothetical protein  33.53 
 
 
230 aa  101  8e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0838  hypothetical protein  30.81 
 
 
227 aa  100  2e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1687  hypothetical protein  32.34 
 
 
229 aa  99.4  4e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2009  integral membrane protein  33 
 
 
227 aa  99.4  4e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.265037  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1672  hypothetical protein  32.34 
 
 
229 aa  99.4  4e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2670  hypothetical protein  32.34 
 
 
229 aa  99.4  4e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0247863  normal  0.0326999 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2580  hypothetical protein  32.34 
 
 
229 aa  97.4  2e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.137209 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1709  hypothetical protein  31.74 
 
 
229 aa  96.3  3e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.349747  normal  0.551967 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2418  hypothetical protein  31.74 
 
 
229 aa  95.5  5e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2108  hypothetical protein  33.16 
 
 
229 aa  94.7  1e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2488  hypothetical protein  31.14 
 
 
229 aa  94  2e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.254099  normal  0.183703 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1193  hypothetical protein  31.62 
 
 
231 aa  93.2  3e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00338949  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1378  hypothetical protein  29.41 
 
 
227 aa  89.4  4e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.157489  hitchhiker  0.00418974 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3177  hypothetical protein  28.57 
 
 
224 aa  88.6  7e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.963449  normal  0.277595 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1300  hypothetical protein  30.52 
 
 
226 aa  85.5  5e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.559066  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1976  hypothetical protein  28.51 
 
 
224 aa  76.3  0.0000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0596109  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1057  membrane protein-like protein  27.75 
 
 
224 aa  72  0.000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000521031  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5548  membrane protein-like  28.8 
 
 
224 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00289622  normal  0.29148 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1796  hypothetical protein  27.23 
 
 
224 aa  68.9  0.00000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0318307  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1470  hypothetical protein  27.23 
 
 
224 aa  68.9  0.00000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000039348  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0705  hypothetical protein  27.23 
 
 
224 aa  68.9  0.00000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000216934  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1164  hypothetical protein  27.23 
 
 
224 aa  68.9  0.00000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000207378  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0447  hypothetical protein  27.23 
 
 
224 aa  68.9  0.00000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0426416  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1333  hypothetical protein  27.23 
 
 
224 aa  68.9  0.00000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1324  hypothetical protein  27.23 
 
 
224 aa  68.9  0.00000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0672472  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2244  membrane protein-like protein  28.27 
 
 
224 aa  68.6  0.00000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00331995  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1608  membrane protein-like  28.27 
 
 
224 aa  68.6  0.00000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0433487  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2258  membrane protein-like protein  28.27 
 
 
224 aa  68.6  0.00000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.111038  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2220  membrane protein-like protein  28.27 
 
 
224 aa  68.6  0.00000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.490411  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2137  membrane protein-like protein  28.27 
 
 
224 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00282185  normal  0.946217 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1093  hypothetical protein  27.78 
 
 
224 aa  65.1  0.0000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0281533  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1271  membrane protein-like protein  27.27 
 
 
213 aa  51.6  0.000009  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4222  hypothetical protein  26.47 
 
 
207 aa  45.8  0.0005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.210811 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2847  hypothetical protein  26.51 
 
 
221 aa  42.4  0.006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.321137  normal  0.576348 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>