22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_0475 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_0475  proline-rich region  100 
 
 		 179 aa  349  1e-95  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2917  hypothetical protein  47.73 
 
 		 138 aa  145  3e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0535  proline-rich region  67.35 
 
 		 176 aa  142  3e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.786453  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5476  hypothetical protein  66.67 
 
 		 183 aa  124  8.000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.214473  normal  0.382092 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5385  hypothetical protein  66.67 
 
 		 183 aa  124  8.000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.853683  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3309  hypothetical protein  70.45 
 
 		 179 aa  122  3e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.586862  normal  0.148953 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4793  hypothetical protein  66.67 
 
 		 182 aa  121  4e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.728187  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0177  hypothetical protein  72.13 
 
 		 184 aa  119  3e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.359864 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2596  proline-rich region  53.79 
 
 		 178 aa  116  1.9999999999999998e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0286  proline-rich region  57.58 
 
 		 184 aa  110  1.0000000000000001e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00400421  normal  0.989783 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3534  hypothetical protein  37.36 
 
 		 177 aa  96.3  2e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.00335662  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3565  hypothetical protein  44.12 
 
 		 194 aa  88.6  4e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.774356 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2107  hypothetical protein  43.8 
 
 		 172 aa  88.2  6e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0234  hypothetical protein  47.86 
 
 		 174 aa  87  1e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000172707  hitchhiker  1.2566e-16 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0820  hypothetical protein  39.49 
 
 		 176 aa  87  1e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000000126881  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3441  hypothetical protein  39.87 
 
 		 176 aa  84.7  6e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.692660000000001e-26 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0868  proline-rich region  56.45 
 
 		 176 aa  82  0.000000000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.726488  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1658  hypothetical protein  48.09 
 
 		 167 aa  70.9  0.00000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3193  hypothetical protein  39.87 
 
 		 195 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0357041  normal  0.346099 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0773  hypothetical protein  42.75 
 
 		 185 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.884129 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2588  hypothetical protein  61.82 
 
 		 181 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.797592  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7170  hypothetical protein  38.62 
 
 		 185 aa  58.5  0.00000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>