22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_0286 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_0286  proline-rich region  100 
 
 		 184 aa  367  1e-101  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00400421  normal  0.989783 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2596  proline-rich region  51.3 
 
 		 178 aa  117  9.999999999999999e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0535  proline-rich region  54.29 
 
 		 176 aa  115  3e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.786453  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5476  hypothetical protein  56.72 
 
 		 183 aa  106  2e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.214473  normal  0.382092 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5385  hypothetical protein  56.72 
 
 		 183 aa  106  2e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.853683  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4793  hypothetical protein  55.97 
 
 		 182 aa  104  7e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.728187  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0475  proline-rich region  54.07 
 
 		 179 aa  104  9e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2917  hypothetical protein  40.74 
 
 		 138 aa  100  9e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3309  hypothetical protein  54.55 
 
 		 179 aa  100  1e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.586862  normal  0.148953 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3534  hypothetical protein  38.29 
 
 		 177 aa  99.4  2e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.00335662  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2107  hypothetical protein  47.52 
 
 		 172 aa  98.2  5e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0177  hypothetical protein  55.65 
 
 		 184 aa  96.7  2e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.359864 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0820  hypothetical protein  45.74 
 
 		 176 aa  92  4e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000000126881  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3441  hypothetical protein  46.03 
 
 		 176 aa  90.9  1e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.692660000000001e-26 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0234  hypothetical protein  45.07 
 
 		 174 aa  89.4  3e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000172707  hitchhiker  1.2566e-16 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3565  hypothetical protein  47.62 
 
 		 194 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.774356 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0868  proline-rich region  48.78 
 
 		 176 aa  65.9  0.0000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.726488  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3193  hypothetical protein  45.8 
 
 		 195 aa  62  0.000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0357041  normal  0.346099 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1658  hypothetical protein  42.86 
 
 		 167 aa  60.8  0.00000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0773  hypothetical protein  46.62 
 
 		 185 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.884129 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2588  hypothetical protein  53.33 
 
 		 181 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.797592  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7170  hypothetical protein  41.84 
 
 		 185 aa  48.1  0.00008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>