20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_7170 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010676  Bphyt_7170  hypothetical protein  100 
 
 
185 aa  359  2e-98  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3565  hypothetical protein  62.87 
 
 
194 aa  150  7e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.774356 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0773  hypothetical protein  65.64 
 
 
185 aa  137  7.999999999999999e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.884129 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3193  hypothetical protein  64.9 
 
 
195 aa  125  5e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0357041  normal  0.346099 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3534  hypothetical protein  36.31 
 
 
177 aa  76.6  0.0000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.00335662  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2596  proline-rich region  39.53 
 
 
178 aa  76.6  0.0000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2107  hypothetical protein  49.25 
 
 
172 aa  73.9  0.000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5385  hypothetical protein  41.96 
 
 
183 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.853683  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5476  hypothetical protein  41.96 
 
 
183 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.214473  normal  0.382092 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4793  hypothetical protein  41.96 
 
 
182 aa  65.5  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.728187  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0475  proline-rich region  40.69 
 
 
179 aa  62.4  0.000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0286  proline-rich region  43.85 
 
 
184 aa  60.1  0.00000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00400421  normal  0.989783 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0234  hypothetical protein  32.72 
 
 
174 aa  59.7  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000172707  hitchhiker  1.2566e-16 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0177  hypothetical protein  43.41 
 
 
184 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.359864 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1658  hypothetical protein  36.43 
 
 
167 aa  58.5  0.00000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0820  hypothetical protein  42.18 
 
 
176 aa  58.5  0.00000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000000126881  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0535  proline-rich region  40.28 
 
 
176 aa  57.8  0.00000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.786453  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3441  hypothetical protein  42.18 
 
 
176 aa  57  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.692660000000001e-26 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3309  hypothetical protein  38 
 
 
179 aa  54.7  0.0000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.586862  normal  0.148953 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2917  hypothetical protein  25.6 
 
 
138 aa  46.6  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>