22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_3441 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_3441  hypothetical protein  100 
 
 		 176 aa  356  9.999999999999999e-98  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.692660000000001e-26 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0820  hypothetical protein  97.73 
 
 		 176 aa  250  7e-66  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000000126881  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0234  hypothetical protein  62.64 
 
 		 174 aa  166  2e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000172707  hitchhiker  1.2566e-16 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2107  hypothetical protein  61.22 
 
 		 172 aa  140  9.999999999999999e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3534  hypothetical protein  43.2 
 
 		 177 aa  103  1e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.00335662  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2596  proline-rich region  38.76 
 
 		 178 aa  88.6  4e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0286  proline-rich region  49.6 
 
 		 184 aa  88.2  5e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00400421  normal  0.989783 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0535  proline-rich region  40 
 
 		 176 aa  77  0.0000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.786453  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3565  hypothetical protein  45.18 
 
 		 194 aa  76.6  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.774356 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0475  proline-rich region  40.82 
 
 		 179 aa  74.7  0.0000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5385  hypothetical protein  41.43 
 
 		 183 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.853683  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5476  hypothetical protein  41.43 
 
 		 183 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.214473  normal  0.382092 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3309  hypothetical protein  41.78 
 
 		 179 aa  69.7  0.00000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.586862  normal  0.148953 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4793  hypothetical protein  41.3 
 
 		 182 aa  69.3  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.728187  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0177  hypothetical protein  43.2 
 
 		 184 aa  69.3  0.00000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.359864 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2917  hypothetical protein  31.43 
 
 		 138 aa  68.2  0.00000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1658  hypothetical protein  34.62 
 
 		 167 aa  62  0.000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0773  hypothetical protein  48.53 
 
 		 185 aa  49.3  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.884129 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3193  hypothetical protein  47.29 
 
 		 195 aa  48.9  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0357041  normal  0.346099 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0868  proline-rich region  31.86 
 
 		 176 aa  47  0.0001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.726488  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2588  hypothetical protein  34.23 
 
 		 181 aa  45.4  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.797592  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7170  hypothetical protein  37.97 
 
 		 185 aa  42.4  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>