22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_0820 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011146  Gbem_0820  hypothetical protein  100 
 
 
176 aa  356  9.999999999999999e-98  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000000126881  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3441  hypothetical protein  97.73 
 
 
176 aa  256  1e-67  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.692660000000001e-26 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0234  hypothetical protein  66.46 
 
 
174 aa  165  2.9999999999999998e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000172707  hitchhiker  1.2566e-16 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2107  hypothetical protein  61.22 
 
 
172 aa  141  6e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3534  hypothetical protein  43.79 
 
 
177 aa  105  3e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.00335662  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0286  proline-rich region  50.4 
 
 
184 aa  90.1  1e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00400421  normal  0.989783 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2596  proline-rich region  39.66 
 
 
178 aa  86.7  2e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0535  proline-rich region  37.5 
 
 
176 aa  77.4  0.00000000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.786453  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3565  hypothetical protein  44.72 
 
 
194 aa  75.5  0.0000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.774356 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0475  proline-rich region  40.14 
 
 
179 aa  73.6  0.000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5385  hypothetical protein  42.75 
 
 
183 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.853683  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5476  hypothetical protein  42.75 
 
 
183 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.214473  normal  0.382092 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4793  hypothetical protein  42.03 
 
 
182 aa  71.2  0.000000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.728187  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0177  hypothetical protein  44 
 
 
184 aa  70.9  0.000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.359864 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3309  hypothetical protein  42.57 
 
 
179 aa  70.5  0.00000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.586862  normal  0.148953 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2917  hypothetical protein  31.43 
 
 
138 aa  68.9  0.00000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1658  hypothetical protein  34.62 
 
 
167 aa  62.4  0.000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0773  hypothetical protein  49.26 
 
 
185 aa  51.2  0.000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.884129 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3193  hypothetical protein  47.29 
 
 
195 aa  49.3  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0357041  normal  0.346099 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2588  hypothetical protein  35.14 
 
 
181 aa  47.4  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.797592  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0868  proline-rich region  31.86 
 
 
176 aa  46.6  0.0002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.726488  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7170  hypothetical protein  37.97 
 
 
185 aa  43.1  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>