22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_2107 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009483  Gura_2107  hypothetical protein  100 
 
 
172 aa  342  2e-93  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0234  hypothetical protein  67.1 
 
 
174 aa  155  2e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000172707  hitchhiker  1.2566e-16 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0820  hypothetical protein  61.84 
 
 
176 aa  139  3e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000000126881  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3441  hypothetical protein  61.59 
 
 
176 aa  137  1e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.692660000000001e-26 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2596  proline-rich region  45.16 
 
 
178 aa  102  2e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0286  proline-rich region  53.17 
 
 
184 aa  90.9  8e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00400421  normal  0.989783 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0535  proline-rich region  49.62 
 
 
176 aa  87.4  8e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.786453  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4793  hypothetical protein  48.25 
 
 
182 aa  87  1e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.728187  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5385  hypothetical protein  47.55 
 
 
183 aa  85.1  5e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.853683  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5476  hypothetical protein  47.55 
 
 
183 aa  85.1  5e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.214473  normal  0.382092 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3534  hypothetical protein  38.1 
 
 
177 aa  84  9e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.00335662  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3565  hypothetical protein  50.38 
 
 
194 aa  82.4  0.000000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.774356 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0475  proline-rich region  43.75 
 
 
179 aa  79.3  0.00000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3309  hypothetical protein  47.18 
 
 
179 aa  79  0.00000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.586862  normal  0.148953 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0177  hypothetical protein  50 
 
 
184 aa  78.6  0.00000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.359864 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1658  hypothetical protein  39.29 
 
 
167 aa  77  0.0000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2917  hypothetical protein  36.03 
 
 
138 aa  70.9  0.000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0773  hypothetical protein  49.25 
 
 
185 aa  61.6  0.000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.884129 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3193  hypothetical protein  50.39 
 
 
195 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0357041  normal  0.346099 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7170  hypothetical protein  49.25 
 
 
185 aa  55.1  0.0000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0868  proline-rich region  35.34 
 
 
176 aa  51.6  0.000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.726488  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2588  hypothetical protein  48.48 
 
 
181 aa  43.1  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.797592  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>