16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_2742 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_2742  hypothetical protein  100 
 
 		 476 aa  953    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0898  hypothetical protein  45.65 
 
 		 461 aa  337  2.9999999999999997e-91  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4922  hypothetical protein  32.67 
 
 		 513 aa  209  8e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.741719 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1814  hypothetical protein  32.09 
 
 		 494 aa  207  5e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0835662  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4860  hypothetical protein  32.14 
 
 		 466 aa  206  1e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0201854 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4585  hypothetical protein  31.29 
 
 		 498 aa  193  7e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00000000152232  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6247  hypothetical protein  31.91 
 
 		 499 aa  192  2e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.594867  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4920  hypothetical protein  31.85 
 
 		 506 aa  190  5.999999999999999e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.404892  normal  0.563369 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6417  hypothetical protein  29.41 
 
 		 501 aa  175  9.999999999999999e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00289521  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4587  hypothetical protein  30.35 
 
 		 467 aa  172  1e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00650998  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0051  hypothetical protein  27.98 
 
 		 503 aa  162  1e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.286541  normal  0.406685 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4586  hypothetical protein  28.43 
 
 		 480 aa  146  7.0000000000000006e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000082424  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1887  hypothetical protein  28.13 
 
 		 452 aa  143  7e-33  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.39427  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1976  hypothetical protein  27.62 
 
 		 447 aa  139  7.999999999999999e-32  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.116034 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10713  hypothetical protein  27.4 
 
 		 441 aa  128  3e-28  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.883584  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12998  hypothetical protein  27.43 
 
 		 433 aa  122  9.999999999999999e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>