16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_4587 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_4587  hypothetical protein  100 
 
 		 467 aa  960    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00650998  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4586  hypothetical protein  42.55 
 
 		 480 aa  389  1e-107  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000082424  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1814  hypothetical protein  35.34 
 
 		 494 aa  245  9.999999999999999e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0835662  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6247  hypothetical protein  33.4 
 
 		 499 aa  244  1.9999999999999999e-63  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.594867  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4920  hypothetical protein  33.81 
 
 		 506 aa  241  1e-62  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.404892  normal  0.563369 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0051  hypothetical protein  31.32 
 
 		 503 aa  228  1e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.286541  normal  0.406685 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4922  hypothetical protein  33.68 
 
 		 513 aa  226  5.0000000000000005e-58  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.741719 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4585  hypothetical protein  32.26 
 
 		 498 aa  215  1.9999999999999998e-54  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00000000152232  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4860  hypothetical protein  31.83 
 
 		 466 aa  191  2.9999999999999997e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0201854 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6417  hypothetical protein  28.32 
 
 		 501 aa  168  2e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00289521  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2742  hypothetical protein  30.43 
 
 		 476 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1976  hypothetical protein  30.53 
 
 		 447 aa  134  5e-30  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.116034 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0898  hypothetical protein  27.59 
 
 		 461 aa  129  9.000000000000001e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1887  hypothetical protein  29.9 
 
 		 452 aa  129  1.0000000000000001e-28  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.39427  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12998  hypothetical protein  25.25 
 
 		 433 aa  111  2.0000000000000002e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10713  hypothetical protein  26.81 
 
 		 441 aa  100  5e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.883584  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>