16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_4585 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_4585  hypothetical protein  100 
 
 
498 aa  1023    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00000000152232  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1814  hypothetical protein  52.9 
 
 
494 aa  490  1e-137  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0835662  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4922  hypothetical protein  38.98 
 
 
513 aa  358  1.9999999999999998e-97  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.741719 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4920  hypothetical protein  39.84 
 
 
506 aa  353  4e-96  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.404892  normal  0.563369 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6417  hypothetical protein  35.29 
 
 
501 aa  267  2.9999999999999995e-70  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00289521  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6247  hypothetical protein  34.73 
 
 
499 aa  264  2e-69  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.594867  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4860  hypothetical protein  36.91 
 
 
466 aa  257  4e-67  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0201854 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4586  hypothetical protein  32.19 
 
 
480 aa  221  3e-56  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000082424  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4587  hypothetical protein  32.26 
 
 
467 aa  215  1.9999999999999998e-54  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00650998  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0051  hypothetical protein  30.66 
 
 
503 aa  199  1.0000000000000001e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.286541  normal  0.406685 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2742  hypothetical protein  31.6 
 
 
476 aa  180  4e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0898  hypothetical protein  27.77 
 
 
461 aa  152  2e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1887  hypothetical protein  26.69 
 
 
452 aa  129  1.0000000000000001e-28  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.39427  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1976  hypothetical protein  27.07 
 
 
447 aa  124  3e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.116034 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10713  hypothetical protein  27.21 
 
 
441 aa  111  3e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.883584  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12998  hypothetical protein  27.34 
 
 
433 aa  111  3e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>