16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_4922 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_4922  hypothetical protein  100 
 
 		 513 aa  1052    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.741719 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4920  hypothetical protein  45.55 
 
 		 506 aa  391  1e-107  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.404892  normal  0.563369 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1814  hypothetical protein  43.75 
 
 		 494 aa  358  9.999999999999999e-98  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0835662  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4585  hypothetical protein  38.98 
 
 		 498 aa  358  1.9999999999999998e-97  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00000000152232  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6247  hypothetical protein  41.49 
 
 		 499 aa  354  2.9999999999999997e-96  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.594867  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6417  hypothetical protein  38.51 
 
 		 501 aa  317  3e-85  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00289521  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4860  hypothetical protein  38.59 
 
 		 466 aa  296  6e-79  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0201854 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4586  hypothetical protein  32.24 
 
 		 480 aa  228  2e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000082424  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4587  hypothetical protein  33.68 
 
 		 467 aa  226  6e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00650998  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0051  hypothetical protein  31.45 
 
 		 503 aa  209  1e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.286541  normal  0.406685 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2742  hypothetical protein  31.8 
 
 		 476 aa  196  7e-49  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1887  hypothetical protein  28.4 
 
 		 452 aa  182  1e-44  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.39427  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1976  hypothetical protein  29.98 
 
 		 447 aa  179  8e-44  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.116034 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0898  hypothetical protein  28.63 
 
 		 461 aa  148  3e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10713  hypothetical protein  26.07 
 
 		 441 aa  121  3.9999999999999996e-26  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.883584  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12998  hypothetical protein  24.95 
 
 		 433 aa  115  3e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>