16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plut_1887 on replicon NC_007512
Organism: Chlorobium luteolum DSM 273



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007512  Plut_1887  hypothetical protein  100 
 
 
452 aa  917    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.39427  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1976  hypothetical protein  89.5 
 
 
447 aa  804    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.116034 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6247  hypothetical protein  33.73 
 
 
499 aa  187  5e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.594867  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4922  hypothetical protein  28.4 
 
 
513 aa  182  8.000000000000001e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.741719 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1814  hypothetical protein  29.98 
 
 
494 aa  166  9e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0835662  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6417  hypothetical protein  30.55 
 
 
501 aa  157  4e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00289521  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4920  hypothetical protein  29.02 
 
 
506 aa  143  5e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.404892  normal  0.563369 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2742  hypothetical protein  27.95 
 
 
476 aa  139  1e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0898  hypothetical protein  27.23 
 
 
461 aa  130  7.000000000000001e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0051  hypothetical protein  29.75 
 
 
503 aa  129  1.0000000000000001e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.286541  normal  0.406685 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4585  hypothetical protein  26.69 
 
 
498 aa  129  1.0000000000000001e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00000000152232  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4587  hypothetical protein  29.9 
 
 
467 aa  129  1.0000000000000001e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00650998  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4586  hypothetical protein  26.28 
 
 
480 aa  125  2e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000082424  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4860  hypothetical protein  27.52 
 
 
466 aa  122  9e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0201854 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12998  hypothetical protein  28.61 
 
 
433 aa  119  9.999999999999999e-26  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10713  hypothetical protein  30.07 
 
 
441 aa  118  3e-25  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.883584  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>