16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_10713 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014230  CA2559_10713  hypothetical protein  100 
 
 
441 aa  902    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.883584  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12998  hypothetical protein  50.62 
 
 
433 aa  416  9.999999999999999e-116  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0898  hypothetical protein  27.63 
 
 
461 aa  125  2e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4860  hypothetical protein  27.55 
 
 
466 aa  121  1.9999999999999998e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0201854 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4922  hypothetical protein  26.07 
 
 
513 aa  121  3e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.741719 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1887  hypothetical protein  30.07 
 
 
452 aa  118  1.9999999999999998e-25  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.39427  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2742  hypothetical protein  28.07 
 
 
476 aa  116  7.999999999999999e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6247  hypothetical protein  26.83 
 
 
499 aa  116  7.999999999999999e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.594867  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6417  hypothetical protein  26.02 
 
 
501 aa  114  3e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00289521  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4585  hypothetical protein  27.21 
 
 
498 aa  111  3e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00000000152232  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4920  hypothetical protein  25.93 
 
 
506 aa  110  7.000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.404892  normal  0.563369 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1976  hypothetical protein  29.08 
 
 
447 aa  107  4e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.116034 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1814  hypothetical protein  27.41 
 
 
494 aa  103  9e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0835662  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4587  hypothetical protein  26.81 
 
 
467 aa  100  5e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00650998  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4586  hypothetical protein  22.3 
 
 
480 aa  72  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000082424  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0051  hypothetical protein  25 
 
 
503 aa  70.9  0.00000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.286541  normal  0.406685 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>