14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_1914 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_1914  hypothetical protein  100 
 
 		 292 aa  587  1e-167  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.000177004  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4748  hypothetical protein  30.67 
 
 		 318 aa  117  1.9999999999999998e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0240128  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3492  hypothetical protein  30.86 
 
 		 310 aa  104  2e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.142523  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0068  hypothetical protein  26.55 
 
 		 341 aa  104  2e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.997714  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1960  hypothetical protein  27.66 
 
 		 316 aa  101  1e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.190319 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1560  hypothetical protein  30.11 
 
 		 308 aa  101  2e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000420757  normal  0.775354 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0385  hypothetical protein  28.72 
 
 		 316 aa  100  4e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.141802 
 
 
-
 
NC_002950  PG1786  hypothetical protein  27.42 
 
 		 294 aa  86.3  6e-16  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1330  conserved hypothetical protein, secreted  29.54 
 
 		 339 aa  82.4  0.000000000000008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1522  hypothetical protein  26.44 
 
 		 333 aa  76.3  0.0000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.526454  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0936  conserved hypothetical protein, secreted  24.16 
 
 		 299 aa  73.9  0.000000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0362607  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1173  hypothetical protein  21.58 
 
 		 316 aa  64.7  0.000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04490  hypothetical protein  23 
 
 		 304 aa  60.1  0.00000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1304  hypothetical protein  28.03 
 
 		 446 aa  47.4  0.0003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>