14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_1330 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_1330  conserved hypothetical protein, secreted  100 
 
 		 339 aa  694    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1522  hypothetical protein  44.71 
 
 		 333 aa  259  4e-68  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.526454  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1786  hypothetical protein  35.86 
 
 		 294 aa  190  4e-47  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0385  hypothetical protein  31.85 
 
 		 316 aa  157  2e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.141802 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1960  hypothetical protein  35.11 
 
 		 316 aa  133  3.9999999999999996e-30  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.190319 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1173  hypothetical protein  27.76 
 
 		 316 aa  117  3e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0936  conserved hypothetical protein, secreted  28.82 
 
 		 299 aa  115  1.0000000000000001e-24  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0362607  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04490  hypothetical protein  27.36 
 
 		 304 aa  98.6  2e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1560  hypothetical protein  28.29 
 
 		 308 aa  95.9  9e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000420757  normal  0.775354 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3492  hypothetical protein  29.18 
 
 		 310 aa  94.7  2e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.142523  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4748  hypothetical protein  26.28 
 
 		 318 aa  84  0.000000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0240128  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1914  hypothetical protein  29.54 
 
 		 292 aa  82.4  0.00000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.000177004  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0068  hypothetical protein  25.85 
 
 		 341 aa  77  0.0000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.997714  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1304  hypothetical protein  26.89 
 
 		 446 aa  59.3  0.00000008  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>