13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_0385 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_0385  hypothetical protein  100 
 
 		 316 aa  648    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.141802 
 
 
-
 
NC_002950  PG1786  hypothetical protein  39.72 
 
 		 294 aa  192  6e-48  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1960  hypothetical protein  34.08 
 
 		 316 aa  180  2.9999999999999997e-44  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.190319 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1173  hypothetical protein  32.84 
 
 		 316 aa  159  7e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1330  conserved hypothetical protein, secreted  31.85 
 
 		 339 aa  157  2e-37  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1522  hypothetical protein  33.22 
 
 		 333 aa  151  2e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.526454  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0936  conserved hypothetical protein, secreted  34.15 
 
 		 299 aa  142  9e-33  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0362607  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04490  hypothetical protein  33.22 
 
 		 304 aa  140  1.9999999999999998e-32  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4748  hypothetical protein  29.94 
 
 		 318 aa  129  6e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0240128  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1560  hypothetical protein  34.84 
 
 		 308 aa  129  8.000000000000001e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000420757  normal  0.775354 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3492  hypothetical protein  33.56 
 
 		 310 aa  120  3.9999999999999996e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.142523  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1914  hypothetical protein  28.72 
 
 		 292 aa  100  4e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.000177004  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0068  hypothetical protein  25.69 
 
 		 341 aa  86.7  4e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.997714  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>