14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_1960 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_1960  hypothetical protein  100 
 
 		 316 aa  645    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.190319 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0385  hypothetical protein  34.08 
 
 		 316 aa  182  5.0000000000000004e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.141802 
 
 
-
 
NC_002950  PG1786  hypothetical protein  36.43 
 
 		 294 aa  153  2.9999999999999998e-36  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1330  conserved hypothetical protein, secreted  35.11 
 
 		 339 aa  134  1.9999999999999998e-30  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1522  hypothetical protein  28.61 
 
 		 333 aa  121  1.9999999999999998e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.526454  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1560  hypothetical protein  32.14 
 
 		 308 aa  120  1.9999999999999998e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000420757  normal  0.775354 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3492  hypothetical protein  33.57 
 
 		 310 aa  117  1.9999999999999998e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.142523  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4748  hypothetical protein  27.85 
 
 		 318 aa  115  8.999999999999998e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0240128  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1173  hypothetical protein  29.87 
 
 		 316 aa  115  1.0000000000000001e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1914  hypothetical protein  27.66 
 
 		 292 aa  105  1e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.000177004  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0936  conserved hypothetical protein, secreted  27.68 
 
 		 299 aa  100  2e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0362607  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0068  hypothetical protein  27.4 
 
 		 341 aa  93.2  5e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.997714  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04490  hypothetical protein  25.38 
 
 		 304 aa  92.4  9e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1304  hypothetical protein  21.59 
 
 		 446 aa  48.5  0.0002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>