21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_5886 on replicon NC_012853
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012853  Rleg_5886  hypothetical protein  100 
 
 
76 aa  153  1e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6917  hypothetical protein  76.32 
 
 
78 aa  115  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5781  hypothetical protein  76.32 
 
 
78 aa  92.4  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.31747  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5880  hypothetical protein  75 
 
 
78 aa  90.9  5e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.671505  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5838  hypothetical protein  76 
 
 
82 aa  90.5  7e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.167751  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4743  hypothetical protein  54.67 
 
 
78 aa  80.5  0.000000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.990043  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0790  hypothetical protein  38.16 
 
 
78 aa  60.5  0.000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.628779  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1536  hypothetical protein  38.03 
 
 
77 aa  55.1  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.319993  normal  0.280923 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5711  hypothetical protein  37.33 
 
 
133 aa  50.8  0.000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3859  hypothetical protein  42.31 
 
 
82 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.150331 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0076  hypothetical protein  39.51 
 
 
86 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0785  hypothetical protein  38.75 
 
 
85 aa  47  0.00009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.325049  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5865  hypothetical protein  63.64 
 
 
40 aa  44.3  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.212925  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5763  hypothetical protein  38.89 
 
 
79 aa  43.9  0.0007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5597  hypothetical protein  29.17 
 
 
79 aa  42  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000927603 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6895  hypothetical protein  29.17 
 
 
79 aa  42  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.693773 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0062  hypothetical protein  37.97 
 
 
86 aa  41.2  0.004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0954  hypothetical protein  33.33 
 
 
84 aa  41.6  0.004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3387  hypothetical protein  36.71 
 
 
86 aa  41.2  0.005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3377  hypothetical protein  40.32 
 
 
73 aa  40.8  0.007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0078  hypothetical protein  43.64 
 
 
84 aa  40.4  0.007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>