21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_0790 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_0790  hypothetical protein  100 
 
 		 78 aa  152  1e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.628779  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1926  hypothetical protein  53.25 
 
 		 78 aa  64.3  0.0000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.452798  normal  0.0548297 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6917  hypothetical protein  37.66 
 
 		 78 aa  59.3  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5763  hypothetical protein  39.73 
 
 		 79 aa  58.5  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4743  hypothetical protein  37.33 
 
 		 78 aa  53.9  0.0000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.990043  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5597  hypothetical protein  39.47 
 
 		 79 aa  53.5  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000927603 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6895  hypothetical protein  39.47 
 
 		 79 aa  53.5  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.693773 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0076  hypothetical protein  38.27 
 
 		 86 aa  51.6  0.000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0954  hypothetical protein  40.51 
 
 		 84 aa  51.6  0.000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0850  hypothetical protein  35.21 
 
 		 86 aa  49.7  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.176173  decreased coverage  0.000187412 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0062  hypothetical protein  40 
 
 		 86 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0785  hypothetical protein  38.75 
 
 		 85 aa  48.1  0.00003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.325049  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5781  hypothetical protein  41.56 
 
 		 78 aa  47  0.00008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.31747  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5880  hypothetical protein  41.56 
 
 		 78 aa  47  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.671505  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1921  hypothetical protein  54.29 
 
 		 77 aa  45.1  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0174577 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5838  hypothetical protein  40.79 
 
 		 82 aa  45.1  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.167751  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5886  hypothetical protein  38.16 
 
 		 76 aa  45.4  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3387  hypothetical protein  38.75 
 
 		 86 aa  43.5  0.0008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0781  hypothetical protein  36.62 
 
 		 85 aa  42.4  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.93563  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0370  hypothetical protein  48.57 
 
 		 78 aa  40.8  0.005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3740  hypothetical protein  32.89 
 
 		 132 aa  40.8  0.007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>