19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_5880 on replicon NC_012853
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012853  Rleg_5880  hypothetical protein  100 
 
 
78 aa  155  2e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.671505  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5781  hypothetical protein  98.72 
 
 
78 aa  154  5.0000000000000005e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.31747  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5838  hypothetical protein  98.7 
 
 
82 aa  152  2e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.167751  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6917  hypothetical protein  81.82 
 
 
78 aa  125  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5886  hypothetical protein  75 
 
 
76 aa  94  6e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4743  hypothetical protein  45.33 
 
 
78 aa  67  0.00000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.990043  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1536  hypothetical protein  42.31 
 
 
77 aa  66.6  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.319993  normal  0.280923 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0790  hypothetical protein  41.56 
 
 
78 aa  60.8  0.000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.628779  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5865  hypothetical protein  64.86 
 
 
40 aa  50.8  0.000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.212925  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0076  hypothetical protein  37.5 
 
 
86 aa  47.4  0.00006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0178  hypothetical protein  35.53 
 
 
80 aa  47.4  0.00007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0954  hypothetical protein  36 
 
 
84 aa  44.7  0.0004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5763  hypothetical protein  36.49 
 
 
79 aa  44.7  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5711  hypothetical protein  36.62 
 
 
133 aa  43.9  0.0006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3859  hypothetical protein  40 
 
 
82 aa  43.1  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.150331 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5597  hypothetical protein  32 
 
 
79 aa  43.5  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000927603 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0785  hypothetical protein  39.02 
 
 
85 aa  43.1  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.325049  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6895  hypothetical protein  32 
 
 
79 aa  43.5  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.693773 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0078  hypothetical protein  45.65 
 
 
84 aa  41.2  0.004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>