18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_6895 on replicon NC_012858
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012858  Rleg_6895  hypothetical protein  100 
 
 		 79 aa  157  4e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.693773 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5597  hypothetical protein  100 
 
 		 79 aa  157  4e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000927603 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5763  hypothetical protein  49.35 
 
 		 79 aa  80.9  0.000000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0790  hypothetical protein  39.47 
 
 		 78 aa  53.5  0.000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.628779  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0062  hypothetical protein  39.24 
 
 		 86 aa  50.8  0.000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3387  hypothetical protein  39.24 
 
 		 86 aa  50.4  0.000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3740  hypothetical protein  31.17 
 
 		 132 aa  50.1  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0050  hypothetical protein  35.53 
 
 		 90 aa  45.4  0.0003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7016  hypothetical protein  34.21 
 
 		 90 aa  43.9  0.0008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.148967  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5711  hypothetical protein  32 
 
 		 133 aa  42.7  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6917  hypothetical protein  30.26 
 
 		 78 aa  43.5  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0850  hypothetical protein  34.57 
 
 		 86 aa  42.4  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.176173  decreased coverage  0.000187412 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0954  hypothetical protein  30.26 
 
 		 84 aa  42.4  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0882  hypothetical protein  36.59 
 
 		 89 aa  41.2  0.004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4150  hypothetical protein  34.67 
 
 		 85 aa  40.8  0.006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.819687  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0921  hypothetical protein  36.59 
 
 		 89 aa  40.8  0.006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  decreased coverage  0.00987633  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3472  hypothetical protein  33.33 
 
 		 85 aa  40.8  0.006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.951183  normal  0.935977 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1426  hypothetical protein  31.51 
 
 		 115 aa  40.4  0.008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>