23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_5781 on replicon NC_012853
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012853  Rleg_5781  hypothetical protein  100 
 
 
78 aa  155  2e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.31747  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5880  hypothetical protein  98.72 
 
 
78 aa  154  5.0000000000000005e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.671505  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5838  hypothetical protein  100 
 
 
82 aa  153  9e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.167751  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6917  hypothetical protein  83.12 
 
 
78 aa  127  6e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5886  hypothetical protein  76.32 
 
 
76 aa  95.9  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4743  hypothetical protein  46.67 
 
 
78 aa  68.6  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.990043  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1536  hypothetical protein  41.03 
 
 
77 aa  65.5  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.319993  normal  0.280923 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0790  hypothetical protein  41.56 
 
 
78 aa  61.2  0.000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.628779  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5865  hypothetical protein  67.57 
 
 
40 aa  52.4  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.212925  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0076  hypothetical protein  38.75 
 
 
86 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0178  hypothetical protein  36.84 
 
 
80 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0954  hypothetical protein  36 
 
 
84 aa  45.1  0.0003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6895  hypothetical protein  33.33 
 
 
79 aa  45.1  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.693773 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5763  hypothetical protein  36.49 
 
 
79 aa  45.4  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5597  hypothetical protein  33.33 
 
 
79 aa  45.1  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000927603 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5711  hypothetical protein  36.62 
 
 
133 aa  44.7  0.0004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3859  hypothetical protein  41.33 
 
 
82 aa  44.3  0.0005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.150331 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0785  hypothetical protein  39.02 
 
 
85 aa  43.1  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.325049  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0078  hypothetical protein  45.65 
 
 
84 aa  41.2  0.005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0050  hypothetical protein  33.33 
 
 
90 aa  40.8  0.006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3667  hypothetical protein  35.53 
 
 
85 aa  40.8  0.006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3387  hypothetical protein  37.5 
 
 
86 aa  40.8  0.007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0062  hypothetical protein  38.75 
 
 
86 aa  40.8  0.007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>