19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_0954 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_0954  hypothetical protein  100 
 
 		 84 aa  166  8e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0790  hypothetical protein  40.51 
 
 		 78 aa  51.6  0.000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.628779  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1426  hypothetical protein  34.15 
 
 		 115 aa  48.9  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5763  hypothetical protein  38.16 
 
 		 79 aa  47.4  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0671  hypothetical protein  33.73 
 
 		 85 aa  45.1  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1926  hypothetical protein  36.36 
 
 		 78 aa  45.4  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.452798  normal  0.0548297 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0850  hypothetical protein  33.33 
 
 		 86 aa  44.7  0.0005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.176173  decreased coverage  0.000187412 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5289  hypothetical protein  38.1 
 
 		 89 aa  44.3  0.0006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.726061 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4785  hypothetical protein  31.94 
 
 		 143 aa  42.7  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6917  hypothetical protein  35.06 
 
 		 78 aa  42.4  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6895  hypothetical protein  30.26 
 
 		 79 aa  42.4  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.693773 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5597  hypothetical protein  30.26 
 
 		 79 aa  42.4  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000927603 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0882  hypothetical protein  37.33 
 
 		 89 aa  42.7  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0921  hypothetical protein  37.33 
 
 		 89 aa  42.7  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  decreased coverage  0.00987633  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4743  hypothetical protein  35.53 
 
 		 78 aa  41.2  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.990043  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4722  hypothetical protein  42 
 
 		 71 aa  40.8  0.006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3667  hypothetical protein  33.33 
 
 		 85 aa  40.4  0.009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0857  hypothetical protein  34.67 
 
 		 89 aa  40  0.01  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.945495 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2640  hypothetical protein  33.33 
 
 		 85 aa  40  0.01  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.794076 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>