20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_0921 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_0921  hypothetical protein  100 
 
 		 89 aa  176  9e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  decreased coverage  0.00987633  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0882  hypothetical protein  98.88 
 
 		 89 aa  173  7e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0857  hypothetical protein  83.15 
 
 		 89 aa  146  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.945495 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4563  hypothetical protein  62.92 
 
 		 85 aa  102  2e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.271369  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3667  hypothetical protein  63.51 
 
 		 85 aa  98.6  3e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3268  hypothetical protein  63.51 
 
 		 85 aa  97.8  4e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0671  hypothetical protein  60.26 
 
 		 85 aa  97.4  5e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2640  hypothetical protein  59.49 
 
 		 85 aa  97.1  7e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.794076 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3052  hypothetical protein  58.43 
 
 		 85 aa  93.6  9e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0400386  normal  0.0159704 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6299  hypothetical protein  53.09 
 
 		 85 aa  90.1  9e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.880315 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4150  hypothetical protein  59.46 
 
 		 85 aa  87.8  4e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.819687  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3472  hypothetical protein  54.32 
 
 		 85 aa  86.7  9e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.951183  normal  0.935977 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1895  hypothetical protein  58.11 
 
 		 85 aa  86.7  1e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0304  hypothetical protein  42.47 
 
 		 86 aa  58.5  0.00000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2301  hypothetical protein  37.68 
 
 		 80 aa  48.9  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.662209  hitchhiker  0.00533118 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5516  hypothetical protein  32.47 
 
 		 125 aa  47  0.00008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.186884 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0954  hypothetical protein  37.33 
 
 		 84 aa  42.7  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4442  hypothetical protein  34.21 
 
 		 76 aa  41.2  0.005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.128261 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5597  hypothetical protein  36.59 
 
 		 79 aa  40.8  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000927603 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6895  hypothetical protein  36.59 
 
 		 79 aa  40.8  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.693773 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>