15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_4743 on replicon NC_011368
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011368  Rleg2_4743  hypothetical protein  100 
 
 
78 aa  154  3e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.990043  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6917  hypothetical protein  48 
 
 
78 aa  70.5  0.000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5886  hypothetical protein  54.67 
 
 
76 aa  63.5  0.0000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0790  hypothetical protein  37.33 
 
 
78 aa  53.9  0.0000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.628779  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3740  hypothetical protein  40 
 
 
132 aa  52.8  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5781  hypothetical protein  46.67 
 
 
78 aa  50.4  0.000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.31747  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5838  hypothetical protein  46.58 
 
 
82 aa  48.9  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.167751  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5880  hypothetical protein  45.33 
 
 
78 aa  49.3  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.671505  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5711  hypothetical protein  34.62 
 
 
133 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1426  hypothetical protein  34.62 
 
 
115 aa  46.2  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1536  hypothetical protein  32.39 
 
 
77 aa  45.4  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.319993  normal  0.280923 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3667  hypothetical protein  34.67 
 
 
85 aa  43.9  0.0008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0178  hypothetical protein  38.03 
 
 
80 aa  42  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0954  hypothetical protein  35.53 
 
 
84 aa  41.2  0.004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0076  hypothetical protein  34.57 
 
 
86 aa  40  0.01  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>