17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_4039 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_4039  adenylate cyclase protein  100 
 
 
336 aa  694    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2459  adenylate cyclase protein  59.46 
 
 
353 aa  415  9.999999999999999e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2176  adenylate cyclase protein  58.91 
 
 
346 aa  413  1e-114  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.128241  normal  0.422716 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3625  hypothetical protein  40.16 
 
 
383 aa  249  5e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.133536  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5967  hypothetical protein  38.17 
 
 
391 aa  246  3e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0353378 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1332  hypothetical protein  38.76 
 
 
383 aa  243  3e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.607935 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3458  hypothetical protein  37.57 
 
 
383 aa  239  4e-62  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7113  hypothetical protein  39.03 
 
 
408 aa  236  4e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.79824  normal  0.130912 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1673  hypothetical protein  37.43 
 
 
383 aa  224  1e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.50002  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1886  hypothetical protein  36.29 
 
 
387 aa  223  4e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4588  hypothetical protein  35.61 
 
 
399 aa  214  1.9999999999999998e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.597366  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0162  hypothetical protein  37.47 
 
 
393 aa  210  3e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.451618  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0207  hypothetical protein  34.13 
 
 
417 aa  201  9.999999999999999e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.835179  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3470  hypothetical protein  30.99 
 
 
397 aa  169  4e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.250629  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4597  hypothetical protein  44.86 
 
 
393 aa  145  9e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.216099  normal  0.389941 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0026  hypothetical protein  27.4 
 
 
356 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6058  hypothetical protein  27.27 
 
 
386 aa  122  9.999999999999999e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>