17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_2176 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011369  Rleg2_2176  adenylate cyclase protein  100 
 
 
346 aa  704    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.128241  normal  0.422716 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2459  adenylate cyclase protein  80.46 
 
 
353 aa  572  1.0000000000000001e-162  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4039  adenylate cyclase protein  58.91 
 
 
336 aa  413  1e-114  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5967  hypothetical protein  43.43 
 
 
391 aa  282  6.000000000000001e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0353378 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3625  hypothetical protein  42.11 
 
 
383 aa  260  3e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.133536  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7113  hypothetical protein  40.46 
 
 
408 aa  256  5e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.79824  normal  0.130912 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3458  hypothetical protein  40.73 
 
 
383 aa  253  3e-66  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1332  hypothetical protein  41.81 
 
 
383 aa  253  5.000000000000001e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.607935 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1886  hypothetical protein  40.06 
 
 
387 aa  241  2e-62  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1673  hypothetical protein  41.21 
 
 
383 aa  239  5.999999999999999e-62  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.50002  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4597  hypothetical protein  43.1 
 
 
393 aa  228  1e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.216099  normal  0.389941 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0162  hypothetical protein  41.76 
 
 
393 aa  227  3e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.451618  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4588  hypothetical protein  37.61 
 
 
399 aa  225  7e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.597366  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0207  hypothetical protein  34.32 
 
 
417 aa  196  5.000000000000001e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.835179  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3470  hypothetical protein  31.64 
 
 
397 aa  165  1.0000000000000001e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.250629  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0026  hypothetical protein  27.12 
 
 
356 aa  137  2e-31  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6058  hypothetical protein  27.07 
 
 
386 aa  127  4.0000000000000003e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>