17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_4588 on replicon NC_009620
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009620  Smed_4588  hypothetical protein  100 
 
 
399 aa  807    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.597366  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5967  hypothetical protein  59.28 
 
 
391 aa  460  9.999999999999999e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0353378 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7113  hypothetical protein  59.56 
 
 
408 aa  434  1e-120  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.79824  normal  0.130912 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3458  hypothetical protein  48.27 
 
 
383 aa  341  1e-92  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1332  hypothetical protein  46.92 
 
 
383 aa  328  1.0000000000000001e-88  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.607935 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3625  hypothetical protein  47.21 
 
 
383 aa  312  6.999999999999999e-84  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.133536  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1886  hypothetical protein  47.86 
 
 
387 aa  299  7e-80  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1673  hypothetical protein  47.49 
 
 
383 aa  293  4e-78  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.50002  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4597  hypothetical protein  48.6 
 
 
393 aa  288  1e-76  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.216099  normal  0.389941 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0162  hypothetical protein  46.54 
 
 
393 aa  281  2e-74  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.451618  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2459  adenylate cyclase protein  39.95 
 
 
353 aa  253  4.0000000000000004e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2176  adenylate cyclase protein  37.3 
 
 
346 aa  241  1e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.128241  normal  0.422716 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4039  adenylate cyclase protein  37.06 
 
 
336 aa  231  2e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0207  hypothetical protein  36.08 
 
 
417 aa  213  4.9999999999999996e-54  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.835179  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3470  hypothetical protein  34.81 
 
 
397 aa  199  1.0000000000000001e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.250629  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0026  hypothetical protein  28.61 
 
 
356 aa  149  9e-35  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6058  hypothetical protein  27.84 
 
 
386 aa  132  1.0000000000000001e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>