17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_1886 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_1886  hypothetical protein  100 
 
 		 387 aa  766    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3625  hypothetical protein  75.07 
 
 		 383 aa  573  1.0000000000000001e-162  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.133536  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1673  hypothetical protein  76.12 
 
 		 383 aa  541  1e-153  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.50002  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1332  hypothetical protein  68.19 
 
 		 383 aa  505  9.999999999999999e-143  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.607935 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4597  hypothetical protein  55.92 
 
 		 393 aa  351  1e-95  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.216099  normal  0.389941 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0162  hypothetical protein  54.99 
 
 		 393 aa  344  1e-93  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.451618  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3458  hypothetical protein  48.12 
 
 		 383 aa  344  2e-93  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5967  hypothetical protein  46.72 
 
 		 391 aa  331  2e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0353378 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7113  hypothetical protein  47.49 
 
 		 408 aa  320  1.9999999999999998e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.79824  normal  0.130912 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4588  hypothetical protein  47.08 
 
 		 399 aa  303  3.0000000000000004e-81  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.597366  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2176  adenylate cyclase protein  41.18 
 
 		 346 aa  269  7e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.128241  normal  0.422716 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2459  adenylate cyclase protein  40.05 
 
 		 353 aa  268  2e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4039  adenylate cyclase protein  37.16 
 
 		 336 aa  249  7e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3470  hypothetical protein  36.67 
 
 		 397 aa  213  4.9999999999999996e-54  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.250629  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0207  hypothetical protein  34.72 
 
 		 417 aa  189  7e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.835179  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0026  hypothetical protein  31.16 
 
 		 356 aa  161  2e-38  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6058  hypothetical protein  29.5 
 
 		 386 aa  146  8.000000000000001e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>