26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_3406 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_3406  glycosyltransferase  100 
 
 
314 aa  626  1e-178  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.345767 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3134  putative glycosyltransferase protein  87.3 
 
 
320 aa  552  1e-156  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.868316  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2591  glycosyl transferase family protein  47.68 
 
 
306 aa  277  2e-73  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.642506  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0741  glycosyl transferase family 2  46.9 
 
 
295 aa  259  4e-68  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.181188  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0867  glycosyl transferase, family 2  46.39 
 
 
297 aa  246  3e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6751  glycosyl transferase family protein  46.18 
 
 
311 aa  226  3e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1038  hypothetical protein  48.13 
 
 
262 aa  224  2e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.771085  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2508  glycosyl transferase, family 2  41.67 
 
 
305 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3537  glycosyl transferase family 2  46.39 
 
 
302 aa  192  6e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4549  glycosyl transferase group 1  43.55 
 
 
672 aa  190  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.643981  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1678  glycosyl transferase family protein  43.06 
 
 
313 aa  187  2e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.462735  normal  0.601516 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3769  glycosyl transferase group 1  37.24 
 
 
296 aa  175  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0413  glycosyl transferase family protein  38.36 
 
 
296 aa  150  2e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2352  glycosyl transferase family protein  30 
 
 
317 aa  51.6  0.00002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.164298  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1366  glycosyl transferase family protein  27.04 
 
 
331 aa  50.4  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.959052  normal  0.0372616 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0217  glycosyl transferase family protein  33.17 
 
 
409 aa  49.3  0.00009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0884  b-glycosyltransferase  24.49 
 
 
283 aa  48.1  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.030368  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02810  predicted glycosyltransferase  33.11 
 
 
323 aa  47.4  0.0003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4393  glycosyl transferase family protein  29.66 
 
 
291 aa  45.4  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.023883  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1097  glycosyl transferase family protein  26.09 
 
 
326 aa  44.3  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.000713189  normal  0.938252 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2191  glycosyl transferase family 2  25.28 
 
 
331 aa  44.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2253  glycosyl transferase family 2  25.28 
 
 
331 aa  44.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.628199  normal  0.122057 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4885  glycosyl transferase family 2  30.5 
 
 
344 aa  43.5  0.005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0343644 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0913  putative glycosyltransferase  31.5 
 
 
1066 aa  43.5  0.005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.193043  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3808  glycosyl transferase family 2  30.5 
 
 
344 aa  43.5  0.005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.761497  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1867  glycosyl transferase  25.71 
 
 
283 aa  43.1  0.007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>