30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_1038 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_1038  hypothetical protein  100 
 
 
262 aa  533  1e-151  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.771085  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2591  glycosyl transferase family protein  49.24 
 
 
306 aa  253  2.0000000000000002e-66  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.642506  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2508  glycosyl transferase, family 2  51.13 
 
 
305 aa  253  2.0000000000000002e-66  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0741  glycosyl transferase family 2  49.16 
 
 
295 aa  242  3.9999999999999997e-63  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.181188  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3134  putative glycosyltransferase protein  49.79 
 
 
320 aa  227  1e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.868316  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0867  glycosyl transferase, family 2  45.38 
 
 
297 aa  225  4e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3406  glycosyltransferase  48.13 
 
 
314 aa  224  1e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.345767 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3769  glycosyl transferase group 1  45.35 
 
 
296 aa  205  5e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6751  glycosyl transferase family protein  48.28 
 
 
311 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1678  glycosyl transferase family protein  43.28 
 
 
313 aa  199  5e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.462735  normal  0.601516 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4549  glycosyl transferase group 1  44.7 
 
 
672 aa  181  8.000000000000001e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.643981  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3537  glycosyl transferase family 2  43.51 
 
 
302 aa  159  4e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0413  glycosyl transferase family protein  39.58 
 
 
296 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02810  predicted glycosyltransferase  34.78 
 
 
323 aa  53.1  0.000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5551  glycosyl transferase family protein  34.27 
 
 
319 aa  51.2  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07325  hypothetical protein  23.99 
 
 
334 aa  50.4  0.00003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3728  glycosyl transferase family protein  33.57 
 
 
319 aa  49.7  0.00005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.703441  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1366  glycosyl transferase family protein  25.9 
 
 
331 aa  48.1  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.959052  normal  0.0372616 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3699  glycosyl transferase family protein  32.87 
 
 
319 aa  47.4  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.780358 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0295  glycosyl transferase family protein  24.68 
 
 
334 aa  47.4  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.211949  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3825  glycosyl transferase family protein  32.87 
 
 
319 aa  47.4  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4538  glycosyl transferase family protein  32.87 
 
 
319 aa  47.4  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2271  glycosyl transferase family protein  32.87 
 
 
319 aa  45.8  0.0007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.243207 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02840  predicted glycosyltransferase  29.71 
 
 
642 aa  44.3  0.002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1378  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.54 
 
 
396 aa  43.1  0.005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.80225 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1097  glycosyl transferase family protein  26.35 
 
 
326 aa  42.7  0.006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.000713189  normal  0.938252 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2480  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.83 
 
 
326 aa  42.4  0.008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2618  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.83 
 
 
326 aa  42.4  0.008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2352  glycosyl transferase family protein  32.1 
 
 
317 aa  42.4  0.008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.164298  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0913  putative glycosyltransferase  30.83 
 
 
1066 aa  42.4  0.008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.193043  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>