54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_0413 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_0413  glycosyl transferase family protein  100 
 
 
296 aa  590  1e-168  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6751  glycosyl transferase family protein  40.34 
 
 
311 aa  171  9e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0741  glycosyl transferase family 2  38.57 
 
 
295 aa  165  9e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.181188  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2591  glycosyl transferase family protein  37.09 
 
 
306 aa  164  1.0000000000000001e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.642506  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1678  glycosyl transferase family protein  38.78 
 
 
313 aa  161  1e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.462735  normal  0.601516 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3769  glycosyl transferase group 1  37.33 
 
 
296 aa  161  1e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3406  glycosyltransferase  38.36 
 
 
314 aa  150  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.345767 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2508  glycosyl transferase, family 2  37.58 
 
 
305 aa  150  2e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0867  glycosyl transferase, family 2  36.33 
 
 
297 aa  149  7e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1038  hypothetical protein  39.58 
 
 
262 aa  147  3e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.771085  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3537  glycosyl transferase family 2  37.24 
 
 
302 aa  146  5e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4549  glycosyl transferase group 1  39.73 
 
 
672 aa  145  6e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.643981  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3134  putative glycosyltransferase protein  36.95 
 
 
320 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.868316  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4699  glycosyl transferase family 2  28.69 
 
 
308 aa  53.5  0.000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.252181  normal  0.0261338 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07325  hypothetical protein  22.64 
 
 
334 aa  50.4  0.00003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0295  glycosyl transferase family protein  35.71 
 
 
334 aa  50.1  0.00004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.211949  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0518  family 2 glycosyl transferase  22.59 
 
 
754 aa  50.4  0.00004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00714685  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2618  glycosyl transferase, group 2 family protein  33.15 
 
 
326 aa  48.1  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2480  glycosyl transferase, group 2 family protein  33.15 
 
 
326 aa  48.1  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5523  glycosyl transferase, group 2 family protein  24.07 
 
 
273 aa  47.4  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0548  glycosyl transferase, group 2 family protein  32.61 
 
 
315 aa  47.4  0.0003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0913  putative glycosyltransferase  33.15 
 
 
1066 aa  47.4  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.193043  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5124  glycosyl transferase, group 2 family protein  24.07 
 
 
273 aa  47.4  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5280  glycosyl transferase, group 2 family protein  24.07 
 
 
273 aa  47.4  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2676  glycosyl transferase family protein  27.2 
 
 
294 aa  46.6  0.0005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1366  glycosyl transferase family protein  24.24 
 
 
331 aa  46.6  0.0005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.959052  normal  0.0372616 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3118  family 2 glycosyl transferase  28.19 
 
 
310 aa  46.2  0.0007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1147  glycosyl transferase family 2  46.3 
 
 
330 aa  45.1  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.00000120628  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3699  glycosyl transferase family protein  31.35 
 
 
319 aa  45.4  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.780358 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2241  glycosyl transferase family 2, involved in cell wall biogenesis  31.52 
 
 
310 aa  45.1  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0118567  normal  0.43942 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3825  glycosyl transferase family protein  31.35 
 
 
319 aa  45.4  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4538  glycosyl transferase family protein  31.35 
 
 
319 aa  45.4  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4393  glycosyl transferase family protein  35.56 
 
 
291 aa  44.7  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.023883  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1381  glycosyl transferase, group 2 family protein  34.43 
 
 
302 aa  44.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.247424  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2267  glycosyl transferase, group 2 family protein  34.43 
 
 
315 aa  44.7  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.58247  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3033  glycosyl transferase, group 2 family protein  34.43 
 
 
315 aa  44.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.186654  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3162  glycosyl transferase, group 2 family protein  34.43 
 
 
315 aa  44.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1292  glycosyl transferase, group 2 family protein  34.43 
 
 
315 aa  44.7  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1003  glycosyl transferase, group 2 family protein  34.43 
 
 
315 aa  44.7  0.002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3338  glycosyl transferase family protein  28.8 
 
 
1250 aa  44.7  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2528  glycosyl transferase family 2  25 
 
 
307 aa  43.9  0.003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.591132  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5677  group 2 family glycosyl transferase  24.64 
 
 
267 aa  44.3  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4914  glycosyl transferase family protein  31.89 
 
 
319 aa  43.9  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00141789 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3267  glycosyl transferase family 2  29.36 
 
 
320 aa  43.5  0.004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3009  glycosyl transferase family protein  25.24 
 
 
296 aa  43.5  0.004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0884147  hitchhiker  0.00156221 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0838  glycosyl transferase family protein  28.72 
 
 
349 aa  43.1  0.005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.499828 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5551  glycosyl transferase family protein  31.35 
 
 
319 aa  43.1  0.006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1097  glycosyl transferase family protein  24.15 
 
 
326 aa  43.1  0.006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.000713189  normal  0.938252 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3728  glycosyl transferase family protein  31.35 
 
 
319 aa  43.1  0.006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.703441  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5173  glycosyl transferase family 2  28.33 
 
 
330 aa  42.7  0.007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.65386  normal  0.331666 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4681  glycosyl transferase family protein  29.63 
 
 
345 aa  42.7  0.008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.627848  normal  0.36467 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2245  hypothetical protein  34.83 
 
 
485 aa  42.7  0.008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.462825 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2643  family 2 glycosyl transferase  31.34 
 
 
321 aa  42.4  0.009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0622  glycosyl transferase, group 2 family protein  24.79 
 
 
341 aa  42.4  0.01  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>