41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_3769 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_3769  glycosyl transferase group 1  100 
 
 		 296 aa  606  9.999999999999999e-173  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6751  glycosyl transferase family protein  41.84 
 
 		 311 aa  210  2e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2591  glycosyl transferase family protein  38.46 
 
 		 306 aa  207  2e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.642506  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1038  hypothetical protein  45.35 
 
 		 262 aa  205  6e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.771085  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4549  glycosyl transferase group 1  43.6 
 
 		 672 aa  198  9e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.643981  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0741  glycosyl transferase family 2  37.41 
 
 		 295 aa  196  4.0000000000000005e-49  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.181188  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1678  glycosyl transferase family protein  38.68 
 
 		 313 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.462735  normal  0.601516 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2508  glycosyl transferase, family 2  37.58 
 
 		 305 aa  182  5.0000000000000004e-45  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3537  glycosyl transferase family 2  41.82 
 
 		 302 aa  179  4e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0867  glycosyl transferase, family 2  35.93 
 
 		 297 aa  176  4e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3134  putative glycosyltransferase protein  36.55 
 
 		 320 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.868316  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3406  glycosyltransferase  37.24 
 
 		 314 aa  175  9.999999999999999e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.345767 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0413  glycosyl transferase family protein  37.33 
 
 		 296 aa  161  1e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0838  glycosyl transferase family protein  28.84 
 
 		 349 aa  62  0.00000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.499828 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1123  glycosyl transferase family protein  28.88 
 
 		 315 aa  59.3  0.00000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0764134 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3728  glycosyl transferase family protein  32.21 
 
 		 319 aa  55.5  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.703441  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5551  glycosyl transferase family protein  32.21 
 
 		 319 aa  55.5  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2271  glycosyl transferase family protein  30.77 
 
 		 319 aa  55.1  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.243207 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3699  glycosyl transferase family protein  32.38 
 
 		 319 aa  53.1  0.000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.780358 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3825  glycosyl transferase family protein  32.38 
 
 		 319 aa  53.1  0.000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4538  glycosyl transferase family protein  32.38 
 
 		 319 aa  53.1  0.000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4914  glycosyl transferase family protein  30.29 
 
 		 319 aa  51.6  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00141789 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0548  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.41 
 
 		 315 aa  50.1  0.00005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2480  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.63 
 
 		 326 aa  49.7  0.00007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2618  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.63 
 
 		 326 aa  49.3  0.00008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3219  glycosyl transferase family 2  24.8 
 
 		 314 aa  48.5  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1960  glycosyl transferase family 2  27.81 
 
 		 310 aa  47.8  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2971  glycosyl transferase family 2  25.1 
 
 		 324 aa  47.4  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.797379  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2949  glycosyl transferase family 2  29.92 
 
 		 392 aa  47  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.80757 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3118  family 2 glycosyl transferase  25.27 
 
 		 310 aa  45.8  0.0008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0203  glycosyl transferase family protein  27.92 
 
 		 313 aa  45.8  0.0008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.326499 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1062  glycosyl transferase family protein  28.42 
 
 		 318 aa  44.7  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.851458 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0146  glycosyl transferase family 2  28.64 
 
 		 313 aa  45.1  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.333603 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2355  glycosyltransferase  25.71 
 
 		 320 aa  45.1  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1687  glycosyl transferase family protein  28.38 
 
 		 306 aa  44.7  0.002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.165254  normal  0.0664062 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0913  putative glycosyltransferase  29.63 
 
 		 1066 aa  44.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.193043  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2241  glycosyl transferase family 2, involved in cell wall biogenesis  27.27 
 
 		 310 aa  43.9  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0118567  normal  0.43942 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07325  hypothetical protein  19.93 
 
 		 334 aa  43.5  0.004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3195  glycosyl transferase family 2  32 
 
 		 394 aa  43.1  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0287  glycosyl transferase family 2  28.02 
 
 		 315 aa  42.4  0.009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.201037  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0295  glycosyl transferase family protein  18.57 
 
 		 334 aa  42.4  0.01  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.211949  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>