22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_3534 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011369  Rleg2_3534  Flp/Fap pilin component  100 
 
 		 55 aa  108  3e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3825  Flp/Fap pilin component  70.91 
 
 		 55 aa  81.6  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4473  Flp/Fap pilin component  49.02 
 
 		 62 aa  54.3  0.0000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.837061  normal  0.806364 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4185  Flp/Fap pilin component  47.06 
 
 		 61 aa  52.4  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0223  component of type 4 pilus pilin subunit protein  47.06 
 
 		 61 aa  50.1  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.668081  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0222  component of type 4 pilus pilin subunit protein  47.06 
 
 		 61 aa  50.1  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3349  Flp/Fap pilin component  46.15 
 
 		 61 aa  47.4  0.00007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1794  Flp/Fap pilin component  40.38 
 
 		 54 aa  46.2  0.0001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.55004  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0652  Flp/Fap pilin component  42 
 
 		 57 aa  45.4  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.154723 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4095  Flp/Fap pilin component  41.18 
 
 		 60 aa  45.1  0.0003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5991  Flp/Fap pilin component  43.75 
 
 		 60 aa  44.3  0.0006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.848765  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5317  Flp/Fap pilin component  36.73 
 
 		 58 aa  43.9  0.0008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.26673  hitchhiker  0.000600158 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1493  Flp/Fap pilin component  42 
 
 		 56 aa  43.5  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000102149  hitchhiker  0.00000902291 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1517  Flp/Fap pilin component  42 
 
 		 56 aa  43.5  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000857927  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6287  Flp/Fap pilin component  43.75 
 
 		 60 aa  43.1  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00948182  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1037  Flp/Fap pilin component  42 
 
 		 56 aa  43.5  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000000000708738  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2824  Flp/Fap pilin component  37.74 
 
 		 56 aa  42.4  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.50451  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4699  Flp/Fap pilin component  41.18 
 
 		 53 aa  42.4  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0977464  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2700  Flp/Fap pilin component  47.83 
 
 		 61 aa  42  0.003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.754645  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4197  Flp/Fap pilin component  41.3 
 
 		 54 aa  40.8  0.005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.692127  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2639  Flp/Fap pilin component  35.29 
 
 		 61 aa  40.8  0.006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2405  Flp/Fap pilin component  38 
 
 		 64 aa  40.4  0.007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.842762  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>