18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_1769 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007908  Rfer_1769  hypothetical protein  100 
 
 
285 aa  578  1e-164  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.23774  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2917  hypothetical protein  54.77 
 
 
289 aa  330  2e-89  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.811586  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2256  hypothetical protein  48.58 
 
 
282 aa  285  8e-76  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4243  hypothetical protein  35.09 
 
 
281 aa  123  4e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20060  hypothetical protein  27.5 
 
 
283 aa  122  7e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0343  hypothetical protein  35.71 
 
 
277 aa  120  3.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0321  hypothetical protein  33.77 
 
 
277 aa  115  6e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0332  hypothetical protein  34.38 
 
 
277 aa  113  3e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2896  hypothetical protein  25.86 
 
 
285 aa  94.7  2e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0922  hypothetical protein  27.8 
 
 
287 aa  84  0.000000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.408857  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_47166  predicted protein  31.25 
 
 
338 aa  82  0.000000000000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0596  hypothetical protein  25.74 
 
 
373 aa  77.4  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2334  hypothetical protein  24.41 
 
 
288 aa  71.6  0.00000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0941  hypothetical protein  26.67 
 
 
283 aa  62.8  0.000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.84186  normal  0.788557 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0821  hypothetical protein  20.38 
 
 
278 aa  62  0.00000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.988601  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0285  hypothetical protein  23.87 
 
 
286 aa  56.2  0.0000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0060835  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4966  hypothetical protein  26.47 
 
 
242 aa  53.1  0.000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.276697 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1136  hypothetical protein  20 
 
 
278 aa  50.8  0.00003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.986  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>