15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_0922 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009943  Dole_0922  hypothetical protein  100 
 
 
287 aa  579  1e-164  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.408857  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0941  hypothetical protein  59.45 
 
 
283 aa  303  3.0000000000000004e-81  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.84186  normal  0.788557 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1136  hypothetical protein  27.94 
 
 
278 aa  105  1e-21  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.986  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0821  hypothetical protein  26.43 
 
 
278 aa  102  1e-20  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.988601  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0388  hypothetical protein  25.91 
 
 
278 aa  97.4  2e-19  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1793  hypothetical protein  25.91 
 
 
278 aa  96.7  4e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  decreased coverage  0.00382966  unclonable  0.00000000701935 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2917  hypothetical protein  32.02 
 
 
289 aa  89.7  5e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.811586  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1769  hypothetical protein  27.8 
 
 
285 aa  84  0.000000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.23774  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0332  hypothetical protein  32.07 
 
 
277 aa  82.4  0.000000000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0343  hypothetical protein  32.13 
 
 
277 aa  82  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0321  hypothetical protein  32.52 
 
 
277 aa  78.2  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4966  hypothetical protein  32.09 
 
 
242 aa  67.4  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.276697 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20060  hypothetical protein  22.57 
 
 
283 aa  62.4  0.000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2256  hypothetical protein  28.43 
 
 
282 aa  60.5  0.00000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4243  hypothetical protein  28.81 
 
 
281 aa  58.9  0.00000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>