16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_4966 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_4966  hypothetical protein  100 
 
 
242 aa  491  9.999999999999999e-139  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.276697 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1793  hypothetical protein  24.75 
 
 
278 aa  90.1  2e-17  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  decreased coverage  0.00382966  unclonable  0.00000000701935 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1136  hypothetical protein  22.75 
 
 
278 aa  88.6  8e-17  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.986  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0821  hypothetical protein  22.07 
 
 
278 aa  84.7  0.000000000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.988601  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0388  hypothetical protein  23.11 
 
 
278 aa  83.2  0.000000000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0922  hypothetical protein  32.09 
 
 
287 aa  67.4  0.0000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.408857  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0343  hypothetical protein  28.96 
 
 
277 aa  62  0.000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0332  hypothetical protein  28.9 
 
 
277 aa  57  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20060  hypothetical protein  24.54 
 
 
283 aa  56.6  0.0000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0321  hypothetical protein  27.03 
 
 
277 aa  53.5  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0941  hypothetical protein  26.2 
 
 
283 aa  53.5  0.000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.84186  normal  0.788557 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1769  hypothetical protein  26.47 
 
 
285 aa  53.1  0.000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.23774  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2896  hypothetical protein  23.33 
 
 
285 aa  52.8  0.000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4243  hypothetical protein  28.24 
 
 
281 aa  49.7  0.00004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2917  hypothetical protein  25.41 
 
 
289 aa  48.9  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.811586  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2256  hypothetical protein  23.56 
 
 
282 aa  45.4  0.0009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>